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유럽, 생물정보학 현황 보고서 본 보고서는 유럽 학계에서의 생물정보학(bioinformatics)의 현황을 설명한다. 이 분야의 연구와 지원은 유럽의 각 국가마다 큰 차이가 있다. 몇몇 국가는 오래전부터 생물정보학 연구그룹을 지원하고 있으며 일부 국가는 이미 국가적 생물정보학 인프라를 구축한 반면, 일부 국가들은 현재 구축 단계에 있다. 오늘날의 생명과학에서 EBI(유럽 생물정보학연구소)와 기타 연구소 등이 제공하는 생물정보학 데이터베이스 및 도구는 중추적인 역할을 하며, 생명과학계의 대다수 사용자들은 이들 데이터베이스와 도구의 가용성을 당연하게 받아들인다. 유럽 전역의 사용자들은 생물학적 정보에 대한 인프라(ELIXIR: European Life Sciences Infrastructure for Biological Information)를 확대해야 한다고 주장한다. ELIXIR의 중요한 기능 중의 하나는 유럽에서 생성된 주요 데이터를 포함한 데이터베이스를 제공하고 유지하는 일이다. 이 데이터베이스의 데이터는 오늘날의 생명과학에 매우 중요한 역할을 한다. 합리적인 데이터 수집과 데이터베이스의 구축을 위해 품질 관리, 표준화 등을 포함하는 메커니즘이 필요하다. 각국의 거점기관들은 이러한 문제들을 조정하고, 엄청난 양의 주요 데이터를 분산 저장할 수 있을 것이다. 사용자들은 데이터 구조와 상호운용성 형식에 관한 기준이 필요하다고 주장한다. 또한, 각기 다른 지리적 장소의 다양한 형식의 데이터를 통합할 필요도 있다. 데이터베이스 외에도, 사용자들은 생물정보학 도구(tools)의 장기적인 유지관리도 필요로 한다. 이러한 도구는 초보 사용자에게는 사용자중심적 방식(예: 웹 인터페이스)으로 접근이 가능해야 하며, 프로그램 접속을 위한 기계중심적 방식(웹 서비스)으로도 접근이 가능해야 한다. 게다가, 이들 도구는 표준화된 벤치마킹 데이터집합을 사용하여 정기적으로 평가되어야 한다. 업데이트 및 성능 개선을 위해 대체되어야 할 도구를 제거하는 메커니즘도 있어야 한다. 사용자들은 다양한 사용자층에서 ELIXIR의 데이터베이스와 도구를 사용하므로, 우선순위를 결정하는 메커니즘이 필요하다고 인식한다. 데이터베이스와 도구 외에도, 대규모 생물정보학 분석, 데이터베이스의 업데이트 및 통합 등을 위한 컴퓨팅 자원이 필요하다. 이러한 컴퓨팅 자원은 유럽의 일부 슈퍼컴퓨터센터를 통해 제공될 수 있다. 본 보고서는 생물정보학에 관하여 사용자 관점에서 현재의 요구사항과 향후의 요구사항을 설명한다. 생명과학 분야의 발전은 무한하므로, 생물학적 정보에 대한 유럽의 미래 인프라를 사용자의 요구변화에 따라 적합하고 신속하게 조정하는 일이 중요하다. 목차 1. 서론 2. 사용자 요구사항 3. 다른 연구 인프라와의 상호작용 4. 우선사항 결정 5. ELIXIR 6. 제안 |
