저자(한글) |
Zhu, Chuanzhi,Zhao, Yanlin,Huang, Xiangyu,Feng, Yu,Zhao, Yazhen,Zhuang, Yuhui,He, Xiuyun |
초록 |
목적: 결핵균(Mycobacterium tuberculosis) 스트렙토마이신 약물 내성과 연관되는 잠재적 균체 단백질을 발견하는 것이다. 기법: 결핵균에서 임상 분리된 스트렙토마이신 균주 01105와 결핵균 H37Rv를 비교하였으며 iTRAQ 기술과 바이오 정보학 감정을 거쳐 결핵균에서 임상 분리된 스트렙토마이신 약물 내성 균주 01108 균체 단백질을 상대적 정량 하였으며 WEGO 기능으로 01108균주로부터 유의 발현(differentially expression)된 세포의 구성 요소, 분자 기능 및 생물학적 프로세스를 해석하고 클러스터 분석하였다. 결과: 01108균주는 01105균주 및 H37Rv균주에 비해 유의미한 발현단백질(differentially expressed proteins)은 각각 194개와 146개였으며 01108균주는 01105균주 및 H37Rv균주에 비해 발현된 단백질은 제각기 121개(공통된 유의 미한 발현단백질)였다. 유의미한 발현 단백질 이론에서 상대적 분자량과 등전점(isoelectric point)은 널리 분포되었고 그 생물학적 프로세스는 주로 중간 신진대사, 호흡 작용 및 지질 대사에 관여하며 분자 기능은 주로 활성 촉진 기능과 결합 기능으로 표현된다. 공통된 유의 발현 단백질: 7개의 리보솜 단백질(Rv2785c, Rv0056, Rv0641, Rv0652, Rv0701, Rv1630과 Rv2442c)은 01108균주에서 발현이 감소되었고, 7개의 단백질은 01108 균주에서 뚜렷하게 유의 발현(상향 조절 gt;1.20배 혹은 하향 조절 lt;0.55배)되었는데 이는 각각 티올 페록시다아제(Rv1932), 아실 캐리어 단백질 탈수소 효소(Rv0824c), 30S 리보솜 단백질 S15(Rv2785c), 피루빈산염 탈수소 효소 E2부분(Rv2215), 2성분형 전사 규제 단백질(Rv3133c)과 가상 미지 단백질(Hypothetical agnoprotein)( Rv2466c와 Rv2626c)이었다. 결론: iTRAQ 로 스트렙토마이신의 약물 내성 결핵 마이코박테륨은 스트렙토마이신의 민감 결핵 마이코박테륨과 H37Rv 공동 유의 발현된 단백질과 대응한다는 것을 발견하였으며 이는 향후 결핵 마이코박테륨 스트렙토마이신의 약물 내성 메커니즘을 토의하는데 기초를 마련해주었다 . |