저자(한글) |
MA, Shou-zhi,ZHANG, Tao,DI, Lin-hui,SUN, Yu-lin,XU, Ping,ZHAO, Xiao-hang |
초록 |
단백질체학 연구에서 흔히 고농도 세제를 함유한 완충액으로 단백질 추출 효율을 향상시킨다. 그러나 이런 완충액은 하류(down stream) 단백질의 정량, 효소 분해, 질량 분석 등 절차를 간섭한다. 본 논문은 고농도 세제를 함유한 단백질 샘플 정량과 전처리 과정에 사용되는 짧은 겔법의 효과를 평가하였다. 소 혈청 단백질을 표준 단백질로 사용하여 짧은 겔법에 의한 정량 선형 범위를 분석한 결과, 짧은 겔법 정량의 선형 범위가 1~8μg이었다. 해당 범위 내 샘플 단백질을 정량 검측할 수 있다는 것을 제시한다. 표준 단백질의 정량 선형도가 0.999일 때 중복성이 양호하고 단백질 발현 모드 변화의 영향을 쉽게 받지 않으므로 신뢰성 있는 결과를 얻을 수 있다. 짧은 겔법 정량의 단백질은 겔 내 효소 분해를 통하여 직접 액체 크로마토그래피-질량 분석(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)을 수행할 수 있으며 질량 분석 신호가 양호하다. 실험 결과, 직접적인 짧은 겔법에 의한 고농도 세제 함유의 단백질 샘플 전처리 과정은 단백질체학 연구에서 적용과 확장 가치가 있다는 것을 제시한다. |