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논문 기본정보
Methods of DNA Elements Identification in Epigenomics
논문 개요
| 기관명 | NDSL |
|---|---|
| 저널명 | 生物化學與生物物理進展 = Progress in Biochemistry and Biophysics |
| ISSN | 1000-3282, |
| ISBN |
논문저자 및 소속기관 정보
| 저자(한글) | LU, Yi-ming,QU, Wu-bin,ZHANG, Cheng-gang |
|---|---|
| 저자(영문) | |
| 소속기관 | |
| 소속기관(영문) | |
| 출판인 | |
| 간행물 번호 | |
| 발행연도 | 2014-01-01 |
| 초록 | 인간 전체 유전체(human whole-genome) 서열측정이 이미 완성된 후게놈시대(post-genomic era)에서 유전체 서열의 기능 분석 특히 각종 DNA 조절 요소에 대한 식별은 인간 유전체 복잡 메커니즘을 선진적으로 이해하는데 있어서 병목 문제로 되었다. 최근 염색질 상태 지도(chromatin states mapping)에 대한 대량 연구가 진행됨에 따라 각 유형 DNA 요소 특성화와 관련한 염색질 변형 표시자(chromatin modification signatures)를 밝혔다. 이러한 연구 결과는 감독 학습 및 자율 학습에 기반한 일련의 DNA 요소 예측 방법의 출현을 추진하였다. 이 가운데 일부 방법은 여러 개 유전체 DNA 요소 예측에 이미 성공적으로 응용되었을 뿐만 아니라 알려지지 않은 유전체 분석의 일반적 도구로 되었다. 이러한 예측 방법은 알고리즘 특징 및 예측 전략이 다양함으로 인해 서로 다른 유형의 DNA 요소 예측에 적용된다. 대부분의 경우 사용자는 여러 개 예측 방법을 연합사용함으로써 민감성 및 특이성 예측에서 균형을 이룬다. 비록 여러 종류 알고리즘은 DNA 요소 예측에서 모두 성공적으로 응용된 부분이 있지만 각 알고리즘마다 고유의 폐단이 있어서 사용자는 이러한 폐단을 피해야 한다. 본 논문은 초기 그리고 현재 DNA 요소 예측 방법의 주요 유형을 리뷰(review)하였고 각 방법의 장점과 단점을 전반적으로 분석하였으며 다음 단계 개선에 방향을 제시하였다. 본 논문의 분석 및 관점은 독자가 DNA 요소 예측 알고리즘의 주요 원칙을 깊이있게 이해하는데 도움을 준다. 나아가 관련 연구에서 이러한 방법을 더 유용하게 이용하도록 한다. |
| 원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART71272356 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| DDC 분류 | |
| 주제어 (키워드) | DNA elements,regulation of gene expression,epigenomics,machine learning,DNA 요소,유전자 발현 조절,후성유전체학,기계 학습 |