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논문 기본정보

Computational Analysis on Structure and Function of Human Sperm-specific Lactate Dehydrogenase

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 中國生物化學與分子生物學報 = Chinese journal of biochemistry and molecular biology
ISSN 1007-7626,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

저자, 소속기관, 출판인, 간행물 번호, 발행연도, 초록, 원문UR, 첨부파일 순으로 구성된 논문저자 및 소속기관 정보표입니다
저자(한글) TANG, Ying,YAN, Shui-di,ZHENG, De-zhu,ZHANG, Duo,LIN, Yu-xiang,LAN, Feng-hua
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2013-01-01
초록 정자의 특이적 젖산탈수소효소(lactate dehydrogenase, LDH)를 젖산탈수소효소C4(lactate dehydrogenase C4, LDH-C4)라고도 명명하며, 포유동물이 발육되어 성숙된 고환 조직(testicle tissue) 중 특이적으로 존재하고, 또한 정자 생성, 대사, 에너지 획득과 밀접한 관련성이 있다. 유전자 은행(GenBank) 데이터베이스(data base)의 LDH-C4 아미노산 서열(P07864)을 기반으로 PROSITE 데이터베이스를 이용하여 인간 LDH-C4의 기능 서열을 예측하였으며, 또한 Clustalw2, TreeView1.6.6를 이용하여 LDH-C4 계통수(phylogenetic tree)를 구축하였다. 그리고 I-TASSER 소프트웨어를 이용하여 인간 LDH-C4의 2단계, 3단계, 4단계 구조 및 기능 위치를 예측하였다. 연구 결과, 190~196 위치에 하나의 LDH 활성 위치가 있었는데 해당 위치는 척추동물(vertebrate)의 각 아류형(subtype) 젖산탈수소효소에 모두 존재하는 촉매 위치(catalytic site)로서 진화과정에서 하나의 보존된 서열인 것으로 나타났다. 그러므로 계통수 관점으로 분석하면 LDHC와 LDHB는 유연관계(phylogenetic relationship)가 비교적 가깝다는 것을 설명한다. 인간 LDH-C4와 생쥐 LDH-C4의 2단계, 3단계 구조는 매우 높은 유사성이 있었으며, LDH-C4는 젖산탈수소효소-말산탈수소효소(lactate dehydrogenase-malic dehydrogenase, LDH-MDH) 계열의 NAD 의존성 효소에 속하고, 또한 LDH-1 계열의 기본 구조 특성이 있었다. 연구 결과는 LDH-C4 유전자 돌연변이가 해당 기능에 미치는 영향을 연구하는데 기초를 마련하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART68754790
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과학기술표준분류
ICT 기술분류
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주제어 (키워드) lactate dehydrogenase C4,sperm-specific lactate dehydrogenase,computational analysis,젖산탈수소효소C4,정자 특이적 젖산탈수소효소,전산 생물학적 분석