Significant Genes Extraction and Analysis of Gene Expression Data Based on Matrix Factorization Techniques
기관명 | NDSL |
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저널명 | 生物醫學工程學雜志 = Journal of biomedical engineering |
ISSN | 1001-5515, |
ISBN |
저자(한글) | KONG, Wei,WANG, Juan,MOU, Xiao-yang |
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저자(영문) | |
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소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 2014-01-01 |
초록 | 유전자 사이에는 다양한 발현 제어 활동이 있는데 일반적으로 해당 제어 관계는 유전자 발현 스펙트럼에 내포되어 있다고 알려져 있다. 그러므로 생물학 의의가 있는 정보 및 내포된 유전자 제어 관계를 발굴하기 위해서 유전자 발현 데이터에 근거하여 유전자 제어 상태 모델을 구축할 수 있다. 본 논문은 독립 성분 분석(independent component analysis, ICA)과 비부정 행렬 인수분해(nonnegative ma-trix factorization, NMF) 두 가지 무감독(unsupervised) 행렬 분해(matrix factorization) 기술을 사용하여 알츠하이머병(Alzheimer' s disease, AD) 유전자 발현 데이터의 중요한 유전자를 추출하고 유전자 제어 네트워크를 구축하였으며, 생물학 분석을 통하여 두 가지 서로 다른 행렬 분해 기술이 잠재적인 질병 유전자를 발굴하는 가운데 일으키는 작용을 탐구하였다. 그리고 두 가지 방법을 결부하여 추출한 중요한 유전자에 대하여 생물학 분석을 하고 염증 반응이 AD 질병 메커니즘에서 중요한 작용을 실현함으로써, AD 조기 진단, 질병 메커니즘 연구 및 유전자 바이오 표지물 탐구에 유용한 방법을 제공하였다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART70451666 |
첨부파일 |
과학기술표준분류 | |
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ICT 기술분류 | |
DDC 분류 | |
주제어 (키워드) | matrix factorization,microarray gene expression data,independent component analysis,nonnegative ma-trix factorization,Alzheimer' s disease,행렬 분해,미세 배열 유전자 발현 데이터,독립성분 분석,비부정 행렬 인수분해,알츠하이머병 |