Studying of Chiral Recognition Process of R-2-CPA Dehalogenase from Pseudomonas sp. ZJU26
기관명 | NDSL |
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저널명 | 中國生物工程雜誌 = Journal of Chinese biotechnology |
ISSN | 1671-8135, |
ISBN |
저자(한글) | ZHANG, Ying-tan,YANG, Li-rong,XU, Gang,WU, Jian-ping |
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저자(영문) | |
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소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 2014-01-01 |
초록 | 입체 선택성(stereoselectivity)은 2-할로산 탈할로겐 효소의 가장 중요한 특성 중 하나이다. 그러나 현재 키랄 식별(chiral recognition) 과정은 불분명하며 그에 대한 연구와 해석은 중요한 의미가 있다. 슈도모나스균 ZJU26에서 유래한 R-2-클로로프로피온산 탈할로겐 효소 dehDIV-R을 탬플릿으로 하여 R-2-할로산 탈할로겐 효소의 키랄 식별 과정을 연구하였다. 먼저 반응 생성물의 구조 형태 측정을 통해 dehDIV-R의 촉매 기질은 S N 2 반응인 것을 확인하였다. Discovery Studio 3.0을 사용하여 dehDIV-R에 대한 상동 모델링(homology modeling) 및 기질 분자 도킹(molecular docking)을 수행하였다. 도킹 결과 및 서열 비교를 통해 dehDIV-R 입체 선택성의 핵심 위치 Asn236을 확정하였다. 예측한 dehDIV-R 입체 선택성은 반응시 기질이 반응 위치에 도달하는 입체 장애(steric hindrance)현상과 밀접하게 연관이 되어있다. dehDIV-R에 대한 가상 돌연변이를 통해 Asn236 위치를 입체 장해가 서로 다른 Ala 잔기와 Ser 잔기로 돌연변이시켰다. 예측 결과에 근거하여 Asn236 아미노산 잔기를 위치지정 돌연변이시켰다. Asn236을 Ala로 돌연변이시킨 후 A1 효소는 RS 기질에 대한 활성을 보여주었다. Asn236을 Ser로 돌연변이시킨 후 S1 효소는 원래 효소와 상반되는 입체 선택성을 나타냈고 입체 선택성의 반전 활동성을 보여주었다. 위의 결과는 모델 예측 결과와 일치하였고 모델의 합리성을 입증하였다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART71005674 |
첨부파일 |
과학기술표준분류 | |
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ICT 기술분류 | |
DDC 분류 | |
주제어 (키워드) | 2-CPA dehalogenase,Process of chiral recognition,Molecular docking,2-클로로프로피온산 탈할로겐 효소,키랄 식별 과정,분자 도킹 |