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논문 기본정보

Molecular Cloning and Expression Analysis of MyD88 in Roughskin Soulpin, Trachidermus fasciatus

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 生物技術通報 = Biotechnology bulletin
ISSN 1002-5464,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) BI, Cai-hong,ZHANG, Qiu-xia,YU, Shan-shan,CHEN, Xue-zhao,LIU, Chun-ying,ZHU, Xi
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2015-01-01
초록 골수 분화 인자(myeloid differentiation factor, MyD88)는 TOLL유사 수용체가 유도하는 신호 경로의 핵심 연결 분자(cross-linking molecules)이며, 핵 전사 인자(nuclear factor-kappa B, NF-κB)에 대한 활성화를 통하여 생체의 선천성 면역(innate immunity) 과정에 참여한다. 본 논문은 꺽정이(Trachidermus fasciatus)의 MyD88 유전자(TfMyD88라고 명명)를 클론하였으며, 또한 해당 유전자에 대하여 생물정보학적 분석 및 발현 패턴(expression pattern) 분석을 진행하였다. 연구 결과, TfMyD88 cDNA 서열의 전체 길이가 1,555 bp, 5'UTR 길이가 89 bp, 3'UTR 길이가 599 bp였으며, 개방형 해독틀(open reading frame, ORF)의 길이가 867 bp였고, 288개 아미노산을 코딩하였다. SMART 소프트웨어로 TfMyD88 분자를 예측한 결과, N 말단에 1개의 보존된 사멸 도메인(death domain, DD)이 있었고, C 말단에 전형적인 TIR(Toll/interleukin-1 receptor) 도메인이 있었다. TfMyD88과 기타 척추동물 MyD88의 아미노산 유사성은 57.58%~82.64%에 도달하였고, 계통수(phylogenetic tree) 분석 결과, TfMyD88은 같은 속(genus)에 속하는 Percomorpha의 농어(Lateolabrax japonicus) 및 쏘가리(Siniperca chuatsi) TfMyD88과 같은 분류에 속하였으며, 모든 어류의 MyD88은 진화수의 독립적인 1가지 분류였다. 실시간 PCR(Real-time PCR) 검사 결과, TfMyD88은 꺽정이의 각 조직(tissue)에서 광범위하게 발현되지만 아가미 조직에서 상대 발현량이 가장 높았고, 그 다음으로 비장과 피부에서 발현량이 높았다. 지질다당류(lipopolysaccharide, LPS)로 자극 처리한 후 TfMyD88는 꺽정이의 혈액, 간, 피부, 비장에서 발현이 증가되었다. LPS로 2시간 처리한 후 혈액에서 TfMyD88의 발현량이 약 60배 증가되었고, 피부에서 발현량도 27배 증가하였다. 상술한 연구 결과는 TfMyD88가 꺽정이의 선청성 면역(innate immunity)에 참여한다는 것을 설명한다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75844262
첨부파일

추가정보

과학기술표준분류, ICT 기술분류,DDC 분류,주제어 (키워드) 순으로 구성된 추가정보표입니다
과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Trachidermus fasciatus,MyD88,gene clone,innate immunity,LPS,꺽정이,My D88,유전자 클론,선천성 면역,지질다당류