Estimation of the genome size of Ganoderma lucidum based on a flow cytometric analysis
기관명 | NDSL |
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저널명 | 菌物學報 = Mycosystema |
ISSN | 1672-6472, |
ISBN |
저자(한글) | LI, Qiu-shi,XU, Jiang,ZHU, Ying-jie,SUN, Chao,SONG, Jing-yuan,CHEN, Shi-lin |
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저자(영문) | |
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소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 2013-01-01 |
초록 | 약전(Pharmacopoeia)에서 규정한 영지의 정품 기원인 Ganoderma lucidum를 연구 대상으로 하고 이미 전체 유전체 시퀀싱을 완성한 흑색국균(Aspergillus niger)을 내부 표준(internal standard)으로 하였으며 균사체의 기계적 파쇄를 거쳐 적합한 농도의 세포핵 혼탁액을 얻었으며 프로피듐 요오드화물 염색(Propidium iodide staining) 후에 유동 세포 기술을 이용하여 유전체 크기를 추정하였다. 재료 배양, 샘플 제조, 컴퓨터 분석 등 실험 조건을 최적화하여 영지 유전체 크기가 (48.98±0.60)Mb라는 것을 추정해냈으며 영지 유전체학의 연구에 중요한 자료를 제공하였다. 이 방법은 간편하고 안정적이며 버섯의 범위 내에서 처음으로 전유전체(whole genome) 시퀀싱 데이터를 얻고 광학적 지도(Optical mapping) 결과를 검증하여 버섯 유전체학의 연구에 중요한 기술 플랫폼을 제공하였다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART69978812 |
첨부파일 |
과학기술표준분류 | |
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ICT 기술분류 | |
DDC 분류 | |
주제어 (키워드) | DNA content,fluorescence staining,macrofungi,DNA 함량,형광 염색,버섯 |