| 초록 |
본 논문에서는 구축한 Tomicus yunnanensis 전사체 데이터 베이스에 기반하고 MISA(MicroSatellite) 소프트웨어를 이용하여 해당 미소부수체에 대하여 대규모적인 발굴을 진행하였다. 32,595,681bp의 전사체 서열에서 총 1.098개의 미소부수체 서열을 발굴하였다. 해당 미소부수체 서열에서 모노뉴클레오타이드(mononucleotide)와 트리뉴클레오티드(trinucleotide)의 반복 단위가 가장 많았으며 각각 420개와 482개였다. Six-nucleotide의 미소부수체 반복 단위의 풍부도가 가장 작았으며 3개밖에 되지 않았다. 반복 서열에서 봤을 때, A/T 단일 염기의 반복 서열이 가장 많았으며 367개였다. 그다음으로 AAT/ATT와 ATC/ATG 3염기 서열인데 83개가 있었다. 가장 적은 것은 CG/CG 2염기 서열이며 2개였다. 이상의 연구 결과는 높은 다형성 미소부수체 프라이머를 개발하여 Tomicus yunnanensis의 개체군 유전구조, 개체군 유전 다양성, 기능 유전체학(Functional genomics) 등을 연구하는데 기반을 마련하였다. |
