| 초록 |
[목적] 생물정보학 방법을 이용하여 제브라피쉬 과산화물 환원효소 (Peroxiredoxin, Prx) 패밀리의 구조와 기능을 분석한다. [방법] NCBI 데이터베이스 중의 BLAST 프로그램에 기반하여 제브라피쉬 Prx 서열을 수색하였으며 단백질 아미노산 서열 비교, 계통 발육, 신호 펩타이드, 막관통 영역, 2차구조, 고차구조 및 단백질 상호작용 등 분야로부터 해석하였다. [결과] 제브라피쉬 Prx 패밀리에 6개 성원(Prx1-Prx6)이 있었으며, 항산화 활성의 시스테인(cysteine, Cys)을 함유하였고 막관통 도메인을 함유하지 않았으며 Prx4만 신호 펩타이드를 함유하였다. Prx1-Prx4 서열 상동성은 50%보다 컸으며 공동 선조를 소유하고 있었다. Prx1-Prx5는 티오레독신(thioredoxin)과 상호작용할 수 있으며 Prx6은 글루타티온(Glutathione)과 상호작용할 수 있다. 프롤린, 트레오닌과 아르기닌은 공간 구조에서 제브라피쉬 Prx 활성의 시스테인과 가까웠으며 Prx 항산화활성 발휘에 유리하였다. [결론] 제브라피쉬 Prx 단백질 구조는 척추동물 Prx 특징을 갖고 있으며 잠재적인 항산화 생물학 활성을 갖고 있다. |
