| 저자(한글) |
WANG, Han,ZHAO, Shu-ling,HE, Jiu-jun,YANG, Xiao-lu,ZHOU, Feng,HOU, Ying-chun |
| 초록 |
포유동물의 골형성 단백질(bone morphogenetic proteins, BMPs)은 동물의 연골 형성을 촉진하고, 세포 증식, 분화 및 전이를 조절하는 다양한 기능이 있다. 또한 해당 단백질은 동물 개체 발육 및 인간[호모 사피엔스(Homo sapiens)]의 종양 발생, 발전 과정에서 중요한 역할을 한다. 본 논문은 인간에서 유래한 골형성 단백질 4(bone morphogenetic protein 4, BMP4)를 종자 서열(seed sequence)로 하고, 다양한 생물정보학적 도구를 이용하여 포유동물의 BMP4 단백질 서열 검색 및 그에 따른 상동 단백질(homologous protein) 탐색을 진행하여 72가닥의 완전한 도메인이 있는 상동 단백질 서열을 얻은 후 해당 상동 단백질 서열을 토대로 하여 포유동물의 BMP4 진화 흔적 부위(evolutionary trace) 및 관련 기능성 부위에 대한 비교 연구를 진행하였다. 연구 결과, BMP4 단백질 집단의 TGFβ-프로펩타이드(TGFβ-propeptide) 도메인에는 22개의 전체 집단 보존 잔기(conservative residues)가 있었지만 TGF-β 도메인에는 84개의 하위 집단 특이적 잔기가 있었다. 인간 BMP4 단백질 TGF-β 도메인이 리간드(ligand)와 결합된 부위는 주로 결합 포켓(binding pockets)의 변두리 영역에 분포되었다. 본 연구는 BMP4 단백질의 중요한 기능 영역 잔기 확정 및 기능이 알려지지 않은 위치를 예측하는데 정보를 제공하였다. |
