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논문 기본정보

Cloning and analysis of a halogenase gene of Streptomyces sp. 604F from the Arctic Ocean

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 微生物學報 = Acta microbiologica Sinica
ISSN 0001-6209,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

저자, 소속기관, 출판인, 간행물 번호, 발행연도, 초록, 원문UR, 첨부파일 순으로 구성된 논문저자 및 소속기관 정보표입니다
저자(한글) CHEN, Rui-qin,LIAO, Li,ZHANG, Xiao-hua,CHEN, Bo
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 [목적] 북극 해양 기원의 합성 할로겐화물 잠재력이 있는 스트렙토마이세스(Streptomyces sp.) 604F 중의 하나의 할로게나아제(halogenase) 유전자를 복제하여 할로겐화물 합성 유전자군을 복제하고, 할로겐화물을 분리 감정하기 위한 지침을 제공하고자 한다. [방법] 한천 덩어리법(agar block method)을 이용하여 항균 활성을 초보적으로 측정하고, 액체 크로마토그래피-비행시간 질량분석(LC-TofMS) 기법을 이용하여 Streptomyces sp. 604F 발효 조추출액 중의 할로겐화물을 초보적으로 검출하였으며, 축퇴 PCR(degenerate PCR) 증폭을 이용하여 2차 대사산물의 지표 유전자[I형, II형 폴리케타이드 합성효소(polyketide synthase)와 비리보솜 펩타이드 합성효소(nonribosomal peptide synthetase) 코딩 유전자]를 합성하였다. 플라빈 아데닌 디뉴클레오티드(flavin adenine dinucleotide, FAD)의 할로게나아제 유전자 보수 구간에 의존하여 설계한 축퇴 프라이머(degenerate primer)에 근거하여 유전자 조각을 증폭하고 서열을 측정 분석하였다. 효과적 열 비대칭 교차 PCR(hiTAIL-PCR) 기법을 이용하여 할로게나아제 유전자의 전체 길이를 증폭하였다. [결과] Streptomyces sp. 604F는 비교적 강한 칸디다 알비칸스(Candida albicans) 저항 활성을 가지며, 그 유전체는 동시에 I형 폴리케타이드 합성(Polyketide synthases)효소, II형 폴리케타이드 합성효소, 비-리보솜 펩타이드 합성효소 코딩 유전자 및 할로게나아제 유전자를 함유하였다. 염색체워킹(Chromosome walking) 기법을 이용하여 상기 할로게나아제 유전자의 전체 길이를 복제하였는데 총 1,443bp이며, 하나의 새로운 비-트립토판(non-tryptophan) 할로게나아제를 코딩하였다. 이미 알려진 할로겐화물을 합성한 할로게나아제 데이터베이스 중, Streptomyces sp. 604F와 상동 관계가 가장 가까운 것은 글리코펩다이드계(glycopeptides) 2차 대사산물의 합성에 참여하는 할로게나아제이었다. [결론] Streptomyces sp. 604F는 새로운 비트립토판 할로게나아제를 구비하였고, 글리코펩다이드계 화합물의 할로겐화 수식에 참여한다고 추정한다. 이는 향후 연구에서 목표 할로겐화물을 찾기 위한 지침을 제공하며, 또한, 상기 합성 유전자군을 연구하기 위한 기반을 마련하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART71005359
첨부파일

추가정보

과학기술표준분류, ICT 기술분류,DDC 분류,주제어 (키워드) 순으로 구성된 추가정보표입니다
과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) halogenase,actinomycetes,Arctic,할로게나아제,방선균,북극