| 저자(한글) |
LI, Ping,ZENG, Jun,GAO, Xiaoqi,DONG, Xiuhuang,XUE, Juan,LOU, Kai |
| 초록 |
[목적] 신장 지진 단열지대에서 유황천(cold sulfur spring) 샘물의 군락 구성 및 그 다양성을 연구하는 것이다. [기법] 효소 분해법(enzymatic lysis method)을 이용하여 샘물 샘플에서 직접 총 환경 DNA(Environmental total DNA)를 추출하고 고세균(archaea) 일반 프라이머를 이용하여 16S rRNA 유전자를 증폭한 후, 16S rRNA 유전자 클론 라이브러리를 구축하였다. 또 Alu I와 Afa I 두 가지 제한 효소(restriction enzyme)를 이용하여 임의로 선별한 115개 양성 클론에 대하여 제한 효소 단편 다형성(restriction length polymorphism, RFLP)을 진행하였으며; 각 RFLP 패턴에 대응되는 클론을 시퀀싱하고 그 시퀀싱 결과와 GenBank 서열을 비교한 후, 16S rRNA 유전자 계통수(phylogenetic tree)를 구축하였다. [결과] 고세균 클론 라이브러리에서 총 44개의 OTUs(operational taxonomic units)를 얻었으며 BLAST 서열 비교와 계통 발생 분석을 거쳐 그것들을 유리아케오타(Euryarchaeota, 94.78%)와 타움고세균문(Thaumarchaeota, 4.35%)으로 구분하였다. 타움고세균문 클론과 Nitrosopumilus.sp 서열의 유사성은 93%에 도달하였으며; 유리아케오타는 비교적 다양하였는데 그중 42.61%의 클론은 RC-V cluster에 예속되고, 20.87%와 13.91%의 클론은 각각 LDS cluster와 Methanomicrobiales에 속하였다. 또 4.35%의 클론과 ANME-1a-FW는 아주 높은 유사성을 보였다. 그리고 13.05%의 클론은 유리아케오타의 미지 집단에 속하였다. [결론] 우룸치 제10호 샘물 중의 유리아케오타는 아주 다양하였으며 대량의 새로운 고세균 집단이 잠재되어 있을 가능성이 있었다. |
