| 저자(한글) |
MU, Chun-yu,HUANG, Zheng-yang,CHEN, Yang,WANG, Bin,SU, Yan-hui,LI, Yang,SUN, Zhi-ming,XU, Qi,ZHAO, Wen-ming,CHEN, Guo-hong |
| 초록 |
미토콘드리아 유전체(mitochondrial genome, mtDNA)는 진화 속도가 빠르고 다형성이 풍부하며, 재조합이 없고 모계선형 유전(matrilinear inheritance)을 갖는 등 특성으로 인하여, 개체군유전학, 계통발생학, 분자생태학, 분류학 등 연구를 진행하기 위한 이론적 분자 마커로 되고 있다. 본 연구에서는 개리(Anser cygnoides)의 같은 속 근연종의 미토콘드리아 전 유전체 서열(EU009397.1)에 근거하여 프라이머를 설계한 후, 직접 시퀀싱기술을 이용하여 개리 미토콘드리아 유전체의 전체 서열을 종합 분석하였다. 분석 결과, 개리 미토콘드리아 유전체 서열(GenBank 등록번호: KJ124555)의 전체 길이는 16,739 bp였으며, 22개 tRNA, 2개 rRNA 유전자, 13가지 단백질 코딩 유전자와 하나의 D-loop영역을 포함하고 있었다. 염기조성에서 T가 22.49%를, C가 32.24%를, A가 30.21%를, G가 15.06%를 차지하였으며, 뚜렷한 AT 선호성을 갖고 있지 않았다. 22가지 tRNA는 모두 전형적인 클로버잎 구조를 갖고 있었다. 적색야계(Gallus gallus), Podoces hendersoni의 12S rRNA를 참고로, 개리 12S rRNA의 2차 구조를 예측한 결과, 4개 도메인과 37개 줄기 루프(stem-loop)와 13개 돌출부를 갖고 있었다. D-loop 제어영역의 서열을 분석한 결과, LSP/HSP, ETAS1-2, Goose hairpin, E-box, F-box, D-box, C-box, Bird similarity-box, CSB1-box, CSB-like, OH이 포함되어 있었다. 적색야계를 외부 개체군으로, 근연접합법(Neighbor- joining method, N-J)과 최대우도법(Maxium likelihood, ML) 알고리즘 및 베이지안법(Bayesian method)을 이용하고 미토콘드리아 유전체의 전체 서열에 기반하여 계통진화수를 구축하였다. 결과, 개리와 회색기러기(Anser anser), 큰기러기(Anser fabalis), 쇠기러기(Anser albifrons), 캐나다기러기(Branta canadensis)는 하나의 분지에 속하였으며, 혈연관계가 비교적 근접하였다. 해당 연구 결과는 오리과 미토콘드리아 유전체의 전체 서열을 풍부히 하였으며, 개리의 계통발생과 분자진화 연구 및 유전자원 보호와 합리적인 이용을 위하여 새로운 기초 데이터를 제공하였다. |
