초록 |
본 논문에서는 강낭콩 근류균 Rhizobium etli CFN42의 전 유전체 서열 측정 결과를 이용하고 컴퓨터 기술과 생물정보학 분석 방법을 결합하여, 강낭콩 근류균 단백질체 내의 분비 단백질을 예측하고 분석하였으며, 더 나아가 공생 질소 고정(symbiotic nitrogen fixation)의 분자 메커니즘을 깊이 이해하였다. 분석 결과, 해당 근류균의 5,963개 단백질 가운데 신호 펩타이드를 함유하는 분비 단백질이 332개 있고 전체의 5.4%를 차지하였는데 주로 기질 수송, 물질대사와 신호 전달 등 방면에 관련되었다. 또 기능 기술이 있는 186개 분비 단백질 가운데서는 각각 I, II, III, IV형 분비 시스템과 세린 프로테아제( serine protease )를 식별하였다. 이 단백질들은 근류균에 의한 숙주 식물 감염에 참여할 가능성이 있으며 양자 분자적 대화(molecular cross-talk)의 중요한 참여자였다. 가설 단백질에서 구조 도메인 분석을 통하여 SH3b, BA14K 및 EFh의 구조 도메인을 발견하였으며, 이러한 구조 도메인을 함유하는 분비 단백질은 근류균 신호 전달 경로에 참여하는 가능성이 있다. 근류균의 공생 근류 형성(symbiotic nodulation) 과정에서 분비 단백질은 중요한 작용을 하였다. |