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논문 기본정보

Isolation and Analysis of Expression Profi les under Abiotic Stress Treatments of Two AP2/ERF-B1 Group Transcription Factor Genes from Daucus carota

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 植物生理學報 = Plant physiology journal
ISSN 2095-1108,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) HUANG, Wei,WANG, Feng,TAN, Guo-fei,XU, Zhi-sheng,LI, Meng-yao,XIONG, Ai-sheng
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 AP2/ERF는 식물에 보편적으로 존재하는 중요한 전사인자이며 식물의 전반 생명 주기의 생장 발육과 역경 신호 전달에 참여한다. 본 연구에서는 당근(Daucus carota) '헤이톈우춘(Heitianwucun)'을 실험 재료로 하고 전사체와 게놈 데이터를 기초로 검색하고 조합하여 당근 AP2/ERF 집단의 2가지 전사 인자 유전자 서열인 g39811과 g47170을 얻었다. RT-PCR 방법을 이용하여 '헤이톈우춘'에서 DcERF-B1-1 (g39811)과 DcERF-B1-2 (g47170) 전사 인자 유전자를 복제하였다. 서열 분석 결과, 당근의 DcERF-B1-1과 DcERF-B1-2 전사 인자 유전자에는 각각 630개와 594개의 개방형 해독틀이 있으며, 각각 209개와 197개의 아미노산을 인코딩한다. 모두 상대적으로 보수적인 AP2 도메인을 함유하고 있으며 전형적인 식물 AP2/ERF 전사 인자의 특징을 갖고 있다. 아미노산 구성 성분, 이화학적 성질, 친수성/소수성(hydrophilic / hydrophobic)과 3급 구조로부터 분석한 결과, 당근 DcERF-B1-1과 DcERF-B1-2 전사 인자의 친수성은 소수성 보다 컸으며 아미노산 서열은 친수성 단백질에 속하였다. 공간 구조 분석 결과, 모두 하나의 α나선과 3개의 β중첩을 갖고 있다. 계통수(phylogenic tree) 분석 결과, 두가지 전사인자 유전자는 모두 AP2/ERF 집단 전사인자 중에 ERF 아집단의 B1 그룹에 속한다. 실시간 형광정량 PCR 분석 결과, 저온, 가뭄, 염분 스트레스 조건에서 DcERF-B1-2 전사인자는 DcERF-B1-1 전사인자에 비해 역경에 더욱 크게 응답한다. 고온 조건에서 DcERF-B1-1 전사인자는 DcERF-B1-2 전사인자에 비해 역경에 더욱 크게 응답한다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART71118311
첨부파일

추가정보

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) AP2/ERF,Daucus carota,transcription factor,ERF subfamily,expression profi le,AP2/ERF,당근,전사인자,ERF 아집단,발현 조절