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논문 기본정보

Cloning of DcDREB-A6 Group Transcription Factor Gene from Daucus carota L.and Its Analysis of Expression Profiles Under Abiotic Stress Treatments

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 農業生物技術學報 = Journal of agricultural biotechnology
ISSN 1674-7968,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) HUANG, Wei,WANG, Feng,XU, Zhi-sheng,LI, Meng-yao,XIONG, Ai-sheng
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 탈수반응 요소 결합 단백질(dehydration responsive element-binding protein, DREB) 유사 전사인자는 탈수반응 요소의 결합 단백질로, 비생물 스트레스에 대한 식물의 반응에서 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 당근(Daucus carota L.) 전사체 데이터를 기반으로, 검색과 연결과정을 통하여 하나의 당근 DREB 유사 전사인자 유전자 서열을 얻었고, 그 서열에 근거하여 프라이머를 설계하였으며, RT-PCR기법을 이용하여 '헤이톈우춘(Heitianwucun)'으로부터 전사인자 유전자 DcREB-A6을 얻었다(GenBank 등록번호: KM386646). 서열 분석 결과, 당근에서 얻은 DcDREB-A6 유전자에는 993 bp의 개방형 해독틀(open reading frame)이 포함되었으며, 330개의 아미노산을 코딩할 수 있었다. 아미노산 조성 성분, 물리화학적 성질, 친수성/소수성과 3차 구조를 분석한 결과, 당근 DcDREB-A6 전사인자 단백질의 분자량은 36.68 kD, 등전점은 6.00였으며, 친수송 단백질에 속하였다. 진화수 분석 결과, DcDREB-A6는 APETLA2/에틸렌반응 요소 결합 단백질(AP2/ERF) 패밀리 전사인자 중 DREB 서브패밀리의 A6그룹에 속하였다. 공간 구조를 통하여, 해당 전사인자의 도메인이 전형적인 식물 AP2/ERF 패밀리 전사인자의 구조 특성을 갖고 있으며, 1개의 α-헬릭스(α-helix)와 3개의 β-시트(β sheet)를 갖고 있다는 것을 알 수 있었다. 실시간 정량 형광 PCR을 통하여, 당근 DcDREB-A6 전사인자 유전자가 고온, 저온과 고염분 스트레스에 의해 유도되며, 각각 고온, 저온 처리를 4시간, 2시간 하였을 때, 발현량이 약 2배 증가한다는 것을 알 수 있었다. 염분 스트레스는 해당 유전자에 비교적 큰 영향을 미쳤으며, 8시간 처리하였을 때, 유전자 발현량이 4.6배 증가하였다. 그러나 건조 스트레스를 받았을 때, 해당 유전자의 발현 변화폭은 비교적 작았다. 당근의 DcDREB-A6 전사인자 유전자는 고온, 저온, 건조와 고염분 등 비생물 스트레스에 반응을 보였다. 본 연구결과는 당근 DREB 유사 전사인자의 스트레스 조절에 관한 연구를 한층 더 진행하는데 도움이 된다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75845387
첨부파일

추가정보

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Daucus carota L.,Transcription factor,Dehydration responsive element-binding protein,Fluorescence quantitative PCR,Stress regulation,당근,전사인자,탈수반응 요소 결합 단백질,형광 정량 PCR,스트레스 조절