초록 |
싱카이호(Xingkai Lake)의 야생과 양식 Culter alburnus의 각 같은 조직에서 H-FABP 유전자 발현 차이를 연구하고자, Gen Bank에서 이미 알려진 잉어과 어류의 H-FABP 유전자 서열에 대해 프라이머를 설계하였으며, RT-PCR과 RACE 방법을 이용하여 싱카이호의 Culter alburnus 심장형 지방산 결합 단백질(H-FABP)의 전체 CDS 영역 서열(402 bp), 3'UTR 영역 서열(242 bp)과 5'UTR 영역 서열(134 bp) 총 778 bp의 cDNA 서열을 복제하였다. 이를 Gen Bank에 제출하여 얻은 유전자 등록번호는 KJ629286이다. Blast 비교 결과, 싱카이호의 Culter alburnus H-FABP 유전자의 CDS 영역과 잉어(Cyprinus carpio) 및 Schizothorax prenanti의 상동성은 최고로 91%에 달하였다. 아미노산 상동성 비교 결과, 싱카이호 Culter alburnus H-FABP 아미노산 서열과 무지개송어(Oncorhynchus mykiss)의 상동성은 76%이며, 제브라피시(Danio rerio)와의 상동성은 85%이다. 야생 Culter alburnus의 7개 조직(아가미, 심장, 장, 간췌장, 근육, 신장, 비장) 및 양식 Culter alburnus의 심장을 제외한 나머지 6개 같은 조직에서 H-FABP 유전자 발현을 분석한 결과, H-FABP 유전자는 야생조와 양식조 간췌장에서 발현량이 가장 높았으며, 기타 조직에서 발현량은 뚜렷한 차이가 있었고(P 0.05). 연구 결과, 싱카이호 Culter alburnus H-FABP 유전자 서열은 고도로 보존되었으며, 잉어목 어류와의 상동성이 더 높았다. |