Methods and Progress of Mass Spectrometry-based Selected Reaction Monitoring
기관명 | NDSL |
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저널명 | 生物化學與生物物理進展 = Progress in Biochemistry and Biophysics |
ISSN | 1000-3282, |
ISBN |
저자(한글) | CHANG, Cheng,WU, Song-Feng,MA, Jie,ZHANG, Wei,ZHU, Yun-Ping |
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저자(영문) | |
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소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 2012-01-01 |
초록 | 프로테오믹스 연구가 깊어질수록 질량 분석에 기반한 SRM(selected reaction monitoring)은 바이오마커를 발굴하는 타깃 프로테오믹스(targeted proteomics) 연구의 중요한 수단이 되었다. SRM기술은 가설 정보에 따라 가설 조건에 부합되는 질량 분석 신호를 획득하고, 조건에 부합되지 않는 이온 신호 교란을 제거한다. 이로써 특정 단백질의 정량 정보를 취득한다. SRM기술은 높은 민감도와 정확성이 있으며 동적 범위가 매우 넓다. 본 기술은 실험디자인, 데이터 획득 및 데이터 분석의 3단계로 나누어진다. 그중 가장 중요한 것은 바이오정보학 수법으로 실험 데이터 결과를 총괄하고, 기계 학습 기법으로 총괄한 경험 규칙에 따라 SRM 실험에서 모이온과 자이온 쌍을 예측한다. 데이터 품질 제어와 정량에 의한 바이오정보학 방법 연구는 SRM 데이터의 안정성을 제고하는데 중요한 작용을 한다. 이밖에 SRM 연구를 위해 본 논문에서는 SRM 기술 관련 소프트와 도구 및 데이터베이스 자원을 수집하고 종합하였다. 질량분석기가 끊임없이 발전해 갈수록 새로운 SRM 실험 책략과 분석방법 및 계산도구들도 잇따라 나타난다. 최적화된 실험 책략과 방법, 더욱 정밀한 바이오정보학 계산법과 도구로 SRM은 프로테오믹스의 발전에 있어 더욱 중요한 작용을 발휘하게 될 것이다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART65942522 |
첨부파일 |
과학기술표준분류 | |
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ICT 기술분류 | |
DDC 분류 | |
주제어 (키워드) | targeted proteomics,biological mass spectrometry,selected reaction monitoring,proteotypic peptide,타깃 프로테오믹스,생물 질량 분석,선택반응 검측기법,단백질의 특정 펩티드 |