| 저자(한글) |
NING, Ying-zhi,ZHAO, Kang-ping,XIONG, Jie,YUAN, Dong-xia,MIAO, Wei |
| 초록 |
선택적 이어맞추기(Alternative splicing, AS)는 단백질체 다양성을 형성하고 유전자 발현을 조절하는 중요한 메커니즘이며, 관련 연구는 고등 진핵생물 분야에서 많이 진행했지만, 단세포 진핵생물 분야에서는 비교적 적었고 특히 단세포 원생동물 섬모충에서의 연구 보고도 적었다. 본 논문에서는 단세포 모델의 대량적 원생동물 테트라히메나 테모필라(Tetrahymena thermophila) 전사체 데이터를 기반으로 하여, 선택적 이어맞추기 유전자에 대한 감정과 분석을 진행하였다. 테트라히메나 테모필라에서 모두 2,894개의 선택적 이어맞추기 위치를 감정하고, 관련된 2,698개의 선택적 이어맞추기 유전자를 4가지 유형으로 나눌 수 있다. 전사물(transcript) 조립의 정확도를 고려하여 유전체 예측 모델과 완전히 일치한 선택적 이어맞추기 유전자 464개를 깊이 있게 분석하였다. 그중, 성장(growth)기, 기아(starvation)기 및 접합(conjugation)기의 특이적인 선택적 이어맞추기 유전자는 각각 49개, 79개, 135개였다. 선택적 이어맞추기 유전자의 기능에 대한 분석 결과, 이 유전자에 관련된 기능은 광범위하고 단백질 인산화효소(protein kinase)에 뚜렷하게 축적되었다. 이 결과는 선택적 이어맞추기 유전자가 테트라히메나 테모필라의 단백질 인산화 및 신호 전달 과정에서 중요한 역할을 하는 것으로 밝혀졌다. |
