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논문 기본정보

Spatial characteristics analysis by PCR-DGGE for bacterial communities in surface sediments of Tangxi River, Hefei City

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 應用與環境生物學報 = Chinese journal of applied and environmental biology
ISSN 1006-687x,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

저자, 소속기관, 출판인, 간행물 번호, 발행연도, 초록, 원문UR, 첨부파일 순으로 구성된 논문저자 및 소속기관 정보표입니다
저자(한글) SHEN, Shuo,YANG, Chang-ming,CHENG, Shui-ping
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2015-01-01
초록 미생물은 도시에 있는 강의 퇴적물 물질순환과 오염물질 배출과정에서 큰 작용을 하며, 그 군집구조 특성은 도시 하천에 유입되는 오염 부하 크기 및 도시 하천의 건강 상황을 평가하는 중요한 근거로 될 수 있다. PCR-DGGE 기술을 이용하여 허페이(Hefei) 빈후 신구(Binhu new district) 탕시허 강(Tangxi River)의 서로 다른 하천 구간의 표층 퇴적물 세균 군집 구조 차이를 연구하였으며, DGGE 지도 중 15개 주요 밴드에 대해 회수, 증폭과 시퀀싱 비교를 진행하였다. 다음, 표본점에 대해 UPGMA 클러스터 분석을 진행하였다. 동시에 Monte Carlo 검사와 중복 분석(RDA) 방법을 이용하여 퇴적물 세균 군집 구조와 물리화학 환경 사이의 관계를 탐구하였다. 탐구 결과, 탕시허 강의 서로 다른 표본점 DGGE 지도는 일정한 차이성을 갖고 있으며, 상류에 있는 DGGE 지도 밴드수(평균 약 30개)는 많았으나, 각 밴드의 광도 차이는 뚜렷하지 않았다. 중류에 있는 밴드수는 적었으며, 평균 18개밖에 되지 않았으나 일부 밴드의 광도가 비교적 컸는데 이는 해당 표본점 퇴적물 중에 일부 우점균군이 존재한다는 것을 설명한다. 하류에 있는 밴드수는 상류와 중류 사이에 있으나 여전히 일부 광도가 비교적 큰 밴드가 존재한다. 상류 표본점 퇴적물 세균의 Shannon 다양성 지수(H)는 평균 3.31이었으며, 중류 표본점에 비해 뚜렷하게 높았고 하류 표본점에 비해 조금 높았다. 15개 서열에서, 10개는 GenBank에 등록된 서열과의 상동성이 98%보다 높았으며, 1개는 상동성이 97%이었고, 4개는 유사하였는데 현재까지 순수배양되지 않았다. UPGMA 클러스터 분석 결과, 탕시허 강 표층 퇴적물 중 세균 군집 구조 분포는 뚜렷한 공간적 분이 현상이 존재하였다. Monte Carlo 검사와 RDA 분석 결과, 이온교환상태 질소(IEF-N)는 퇴적물 세균 군집의 공간적 분포 차이에 주도적 작용을 한다(특성값은 0.188, P=0.134). 탕시허 강의 수생식물 분포 특성을 결합하여 분석한 결과, 탕시허 강 수생식생 재배종은 표층 퇴적물 미생물 군집 풍도에 일정한 영향을 미쳤으며, 식생 종류의 영향 효과는 식생 피복도보다 더 뚜렷하였다. 결과적으로 표층 퇴적물 세균 군집 구조 특성은 탕시허 강 유역의 도시화 정도 및 생태회복 효과를 양호하게 묘사할 수 있다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART73115315
첨부파일

추가정보

과학기술표준분류, ICT 기술분류,DDC 분류,주제어 (키워드) 순으로 구성된 추가정보표입니다
과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Tangxi River,surface sediments,ion exchangeable form nitrogen,microbial communities,PCR-DGGE,redundancy analysis,탕시허 강,표층 퇴적물,이온교환상태 질소,미생물 군집,PCR-DGGE,중복 분석