| 초록 |
16S rRNA 서열 측정은 초고속 서열분석(high-throughput sequencing)을 기반으로 하는 장내 미생물(intestinal microbiota)을 연구하는 방법이다. 해당 방법으로 장내 미생물 중의 모든 균종(bacterial species)을 정확하게 정량할 수 있다. 그러므로 해당 방법은 점차적으로 장내 미생물 균종의 풍부도 변화를 연구하는 주요 방법으로 되었다. 장내 미생물 연구에 16S rRNA 서열 측정을 이용하는 과정에서 2개의 중요한 문제점이 존재한다. 하나는 수요에 근거하여 서열 측정 방법을 선택하는 문제이고, 다른 하나는 초고속 서열 분석으로 얻은 대량의 데이터에 대하여 생물정보학적 분석(bioinformatic analysis)을 진행하여 생물학적 의미가 있는 결과를 얻는 문제이다. 본 논문은 서열 측정 플랫폼 선택, 서열 측정 구간 선택, 서열 측정 데이터량 선택 등 3개 측면으로 서열 측정 방법을 선택하는 방안을 토론하였으며, 또한 서열 분류 및 주석(annotation), 군집 구조 분석, 핵심 분류 단위 선별 및 기능 분석 등 측면으로 현재 일반적으로 사용하는 생물정보학적 분석 수단을 종합하여 서술하였다. |
