| 저자(한글) |
LI, Jing-jing,JIU, Min,JIANG, Cheng-ying,WANG, Lun-ji,WANG, Du-chuang,YOU, Xiao-yan |
| 초록 |
[목적] Acidithiobacillus caldus와 Acidithiobacillus ferrooxidans 균주의 유전체 데이터에 대해 비교분석 및 데이터 발굴을 진행한다. [방법] Blast 프로그램, MUMmer 소프트웨어 및 Artemis 비교 소프트웨어를 이용하여 4주 Acidithiobacillus의 유전체 서열과 단백질체 서열에 대해 상동비교 분석 및 비주얼 프레젠테이션(Visual presentation)을 진행하였으며, RT-PCR을 통하여 결실 유전자에 대해 검증하였다. [결과] Acidithiobacillus caldus와 비교할 때, Acidithiobacillus ferrooxidans는 편모 코딩 유전자를 함유하지 않았으며, 비교적 적은 전위요소(transposable element)(26개와 41개)를 함유하였다. Acidithiobacillus caldus는 주요하게 SOX 시스템(clusterⅠ과 clusterⅡ)을 이용하여 무기 황화합물을 산화시킨다. 질산염 환원을 제외한 외, Acidithiobacillus ferrooxidans는 또 질소고정효소(nitrogenase)(AFE1522-1515와 Lferr_1240-1233)를 통하여 질소기체를 고정시켜 질소원을 얻을 수 있다. 이 외, 삽입 서열은 황산화 환원효소 유전자의 결실 및 7개 기능 유전자의 활성 상실 등 현상을 초래하였는데 이는 야금 미생물 유전체가 불안정하다는 것을 설명한다. [결론] 비교유전체학은 Acidithiobacillus 종의 유전체 데이터 정보를 더 발굴하고, 그 유전체 구조 특성 및 야금 형질 등 차이를 제시하는데 중요한 지원을 제공하였다. |
