초록 |
하이난 파트리지(Hainan partridge, Arborophila ardens)는 생존 환경에 대한 선택이 비교적 엄격하고 개체군 수량은 매우 희소하여 멸종 위기 종(species)에 속한다. Arborophila 속의 진화 및 계통 발생(phylogenetic) 관계를 한층 더 연구하기 위해 본 논문에서는 Illumina Hiseq2000 초고속 서열 분석(high-throughput sequencing) 기술을 이용하여 하이난 파트리지의 미토콘드리아 전체 유전체 서열을 얻었다. 비교 유전체학 각도에서 4가지 Arborophila 속 조류의 미토콘드리아 유전체 특징을 분석하였으며 Arborophila 속 조류의 계통 발생 지위를 토의하였다. 연구 결과, (1) 하이난 파트리지의 미토콘드리아 유전체 길이는 16,730bp이고, 13개 단백질 코딩 유전자, 2개 리보솜 RNA 유전자, 22개 수송 RNA 유전자 및 하나의 제어 구역을 코딩하였다. (2) Arborophila 속 종은 정화 선택 작용을 받았으며 진화 과정에서 더욱 많은 비동의 치환(nonsynonymous substitution)을 축적하였다. (3) Arborophila 속은 들꿩과(Phasianidae) 조류 계통수의 기저 위치에 있고 그중에 화이트 네클리스드 파트리지(White-necklaced Partridge, Arborophila gingica)와 루퍼스스로티드파트리지(Rufous-throated Partridge, Arborophila rufogularis)는 자매군(sister group) 관계였다. 그리고 하이난 파트리지는 Arborophila 속의 기저 위치에 있고 기타 3가지 Arborophila 속 조류와의 친족 관계(kinship)가 비교적 멀었다. |