| 초록 |
본 연구는 올리고펩티드의 연쇄성장 과정에서의 배좌의 변화를 조사하기 위하여 알라닌 올리고머 모델의 2량체 부터 5량체 까지 양자화학 계산(QCC)에 의한 구조최적화 계산을 하였다. 말단기의 영향을 확인하기 위하여 N말단 및 C말단이 공히 amide 구조를 갖는 'amide type' ( $CH_3CONH-and-CONHCH_3$ )과 N말단만이 methyl 구조를 갖는 'methyl type' ( $CH_3NH-and-CONHCH_3$ )의 2종류 모델을 준비하였다. 5량체 까지의 구조 최적화 계산 결과 3종류의 형태이성질체로 수렴이 되었다. 안정성이 높은 순서로 각각 ${ alpha}$ 나선형, PPII 유사형, ${ beta}$ 확장형으로 나타났으며, 사슬회전 방향이 서로 반대인 형태이성질체간의 에너지 값은 동일하게 나타났다 (5량체, 'amide type' 좌 우회전형: ${ Delta}E=-1.05$ , 'methyl type' 좌 우회전형: ${ Delta}E=-1.62$ ). ${ alpha}$ 나선형의 모노머 단위당 에너지변화( ${ Delta}E$ )는 모노머의 증가와 함께 감소하였다. |
