| 저자(한글) |
Pan, Xiaoyi,Liu, Dujuan,Shen, Jinyu,Zhang, Yufei,Lin, Lingyun,Yuan, Xuemei,Wang, Junyi,Hao, Guijie,Yao, Jiayun,Xu, Yang |
| 초록 |
Macrobrachium rosenbergii nodavirus(MrNV)와 M.rosenbergii dicistrovirus(MrDV)은 이미 보고된 Macrobrachium rosenbergii를 쉽게 감염될 수 있는 주요 병원성 바이러스이다. 본 논문에서는 이중 RT-PCR(duplex real time-polymerase chain reaction)법을 이용하여, MrDV, MrNV 두 바이러스를 동시에 측정하였다. MrDV과 MrNV 게놈 서열의 보존영역에 근거하여 특이 프라이머를 설계하였으며, 이중 PCR법의 풀림온도(annealing temperature)와 프라이머 농도를 최적화하여, 최적화 반응체계와 반응 조건을 얻은 후, Macrobrachium rosenbergii 샘플에 대한 측정을 진행하였다. 그 결과, 이중 PCR법의 최적 풀림 온도는 60℃, 반응 체계의 최적 프라이머 농도는 MrNV384이 0.1 mu;mol/L, MrDV472이 0.05 mu;mol/L였으며, 샘플 총 RNA의 최저 검출 한계는 360fg이었다. 프라이머의 특이성 측정에서, 해당 측정 방법이 TSV, WSSV, IHHNV, Aeromonas hydrophila TPS-30 게놈에 교차반응을 일으키지 않는 것으로 나타났다. 양성 샘플에 대한 바이러스 증폭 서열 분석에서, MrDV RNA 의존성 RNA 폴리메라아제 코딩 영역 서열에는 변이가 없었으며, MrNV-RNA2 서열에는 변이가 비교적 많은 것으로 나타났다. 계통수 결과로부터 2011년 창장(Yangtse River) 삼각주의 MrNV 바이러스는 주요하게 중국 유전자형과 동남아 유전자형이라는 것을 알 수 있다. 이중 RT-PCR법의 구축은 Macrobrachium rosenbergii 바이러스성 질병의 예방과 종묘 번식에 기초를 마련하였다. |
