A Computer Program to Calculate Total Wedge Angle of Curved DNA
기관명 | NDSL |
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저널명 | 한국생화학회지 |
ISSN | 0368-4881, |
ISBN |
저자(한글) | Lee, Sang-Soo,Park, Kie-Jung,Kang, Chang-Won |
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저자(영문) | |
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소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 1991-01-01 |
초록 | DNA의 흰 정도를 알 수 있게 총 쐐기 각도를 계산하는 컴퓨터 프로그램을 개발하였다. 이 계산은 본질적으로 쐐기 모델에 근거하여 바로 이웃하는 염기 쌍의 횡사 및 경사 쐐기 각도와 비틀림 각도의 새로운 값들을 사용하였다. 각각의 이웃하는 염기 쌍의 쐐기 각도를 긴 DNA 서열을 따라 합산할 때 3차원적 벡터의 합산 방법을 적용하였다. 따라서 이 계산 방법으로 개선된 점은 횡사와 경사 쐐기 각도의 2차원적 벡터 합산에서 계산되는 근사값이 아닌 실제값을 계산할 수 있다는 데에 있다. 주기적으로 반복하며 흰 구조를 가진 것으로 이미 보고된 33개의 DNA 서열을 이 컴퓨터 프로그램으로 분석하였더니, 겔에서의 이동 속도가 축적된 쐐기 각도와 상관관계가 있음이 밝혀졌다. 따라서 순환된 DNA 단편의 겔에서 이동 속도 양상은 이 컴퓨터 프로그램 분석에 의해 예측할 수 있다. 이 프로그램은 또한, 주기적으로 연속된 A 염기를 갖지 않는 pT181 DNA의 축이 복제를 시작하는 부근에서 휨을 정확히 지적하고 있다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=JAKO199134755182808 |
첨부파일 |
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