| 저자(한글) |
XIAO, Wen-jun,HU, Shuai,ZENG, Rong,CHANG, Hong-ping,YUAN, Cong-ying,WANG, Ping,ZHANG, Cheng,LU, Xiu-tao,GUO, Xin-hong |
| 초록 |
호모세린인산화효소(homoserine kinase)(EC 2.7.1.39)는 애기장대에서 메티오닌(methionine)과 트레오닌(threonine)을 합성하는 핵심 효소 중의 하나이다. 본 저자는 DNAMAN 소프트웨어를 이용하여 호모세린인산화효소의 아미노산 구성과 등전점(isoelectric point)을 분석하였다; 생물정보학 온라인 네트워크 예측을 이용하여 소수성(hydrophobic), 2급 구조, 막전위 도메인(trans-membrane domain), 신호 펩티드 영역, PEST 서열, 화학적 수식 위치 및 아세포 위치 결정 등에 대하여 분석하였다; SWISS-MODEL 소프트웨어를 이용하여 상동 모델링(homology modeling)을 실행하고, Chimera(V1.8.1)를 사용하여 구조를 수식하였으며 마지막으로 Molprobity4 및 ERRAT(V2.0)을 사용하여 모델링 구조 결과의 구조 품질 분석하였다. 실험 결과 : HSK 예측 등전점이 8.48이고 편군 친수성(hydrophilicity)이 0.267이었다; 2급구조에서 α-나선 구조가 34.32%를 차지하였으며 불규칙한 권축(Crimp)이 48.11% 차지하였으며, 연장 사슬이 17.57%를 차지하였다; 호모세린인산화효소의 예측 모델을 검증한 결과, 해당 모델의 공간구조는 안정적이며 입체화학(stereochemistry) 규칙에 부합되었다. |
