초록 |
변수모델(parametric models)과 비모수 추정법(nonparametric estimates)을 이용하여 남해(the South China Sea) 대륙사면의 퇴적물 MD05-2896 내 세균의 풍도를 예측하였다. 비배양기 PCR-RFLP의 16S rRNA 유전자 분자기술을 기반으로, 퇴적물 내 세균의 16S rRNA 유전자 서열을 증폭하였으며, 16S rRNA 유전자 베이스를 구축하였다. 계통 유전학적 분석을 통하여, 16S rRNA유전자 베이스의 대부분 서열이 17개 ''문''에 속한다는 것을 발견하였다. 99%, 97%, 90%, 80%의 서열 동일성을 분류 단위 경계점으로, 16S rRNA유전자 서열을 4개의 분류 단위로 나뉘었다. 역 가우스 분포 모델(Inverse Gauss distribution model), 대수 정규 분포 모델( log-normal distribution model), 음이항식 분포 모델(negative binomial distribution model), 파레토 분포 모델(Pareto distribution model), 이중 지수 분포 모델(Double exponential distribution model), ACE, ACE-1 등 추정기법을 이용하여 분류 단위 수준에 따른 세균의 풍도를 예측하였다. 그 결과, ''종''급 분류 수준에서, 음이항식 분포 모델이 가장 적합한 추정 모델이었으며, 추정한 세균의 풍도는 244±10(SE)였다. 제한된 실험 조건으로 인하여 추정치가 낮은 편이었다. |