| 저자(한글) |
FAN, Xiaojun,SONG, Zhifang,XIAN, Xiaoxiao,LI, Yao,ZHAO, Qiuyong |
| 초록 |
본 논문은 생물정보학(bioinformatical) 관점으로 클론하여 얻은 금무늬가는나비(Lithocolletis ringoniella) 키티나아제(chitinase)를 분석하였으며, 또한 과제연구팀을 통하여 유전자은행(GenBank)의 정보를 등록하였다. 그리고 온라인 분석(online analysis) 및 소프트웨어 분석(software analysis)을 이용하여 금무늬가는나비 키티나아제(LrCHI) 유전자 뉴클레오시드(nucleoside)와 아미노산 서열(amino acid sequence)의 조성, 물리화학적 성질(physical and chemical properties), 신호펩티드(signalpeptide), O-글리코실화 위치(O-glycosylation site), 인산화 위치(phosphorylation site), 소수성(hydrophobic character), 2차 구조(secondary structure)와 3차 구조(tertiary structure) 등을 분석 및 예측하였으며, 또한 계통수(phylogenetic tree)를 구축하였다. 연구 결과, LrCHI의 개방형 해독틀(open reading frame)은 1737bp 이고, 578개의 아미노산을 유도하며, 이 서열이 코딩하는 단백질은 키티나아제 18 집단(family)에 속한다. 그리고 N 말단에는 신호펩티드와 키티나아제 18 집단의 활성 위치가 함유되어 있고, C 말단은 키티나아제의 결합 지역이고, 막삼투 구조 영역(transmembrane domain region)이 없다. 이로부터 LrCHI 는 친수성 단백질이고, 또한 금무늬가는나비는 파밤나방(Spodoptera exigua)의 면화씨벌레(cotton bollworm), Beet armyworm와 진화관계가 제일 가깝다는 것을 알 수 있다. 분석 결과는 LrCHI의 과학연구에 유용한 정보를 제공하였으며, 또한 고급 구조(high-level structure)와 기능의 관계를 심층적으로 연구하는데 이론적 근거를 제공하였다. |
