Genome minimization method based on metabolic network analysis and its application to Escherichia coli
기관명 | NDSL |
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저널명 | 生物工程學報 = Chinese journal of biotechnology |
ISSN | 1000-3061, |
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저자(한글) | TANG, Bin-cai,HAO, Tong,YUAN, Qian-qian,CHEN, Tao,MA, Hong-wu |
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소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 2013-01-01 |
초록 | 최소 생명체의 합성은 합성생물학 연구의 주요 방향이다. 게놈을 최소화 하는 동시에 세포의 생장에 영향을 주지 않는 것은 대사공학 연구의 주요 목표이다. 본 논문은 게놈 규모 대사 네트워크(genome-scale metabolic network) 모델에 기초하여 제로 플럭스 반응(zero flux reactions)을 없애고 비필수 유전자 조합을 삭제하여 게놈 최소 대사 네트워크 모델을 만드는 방법을 제기하였다. 해당 방법으로 대장균의 일반 대사 네트워크 모델 iAF1260을 간소화하였다. 즉 기존의 1260개 유전자를 312개 유전자로 간소화 하였으며 최고의 바이오매스 생산 속도는 변화하지 않았다. 게놈 최소 대사 네트워크 모델은 세포가 정상적으로 생장하는 전제하에 최소 유전자를 포함한 대사 경로를 예측하였으며 대장균이 최소 게놈을 얻기 위한 습식실험(wet experiments)에 참고적 가치가 있다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART68364240 |
첨부파일 |
과학기술표준분류 | |
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ICT 기술분류 | |
DDC 분류 | |
주제어 (키워드) | genome-scale metabolic network,genome minimization,combination algorithm,Escherichia coli,게놈 규모 대사 네트워크,게놈 최소화,결합 알고리즘,대장균 |