| 저자(한글) |
TANG, Yao,QIAO, Liang,ZHANG, Yu-juan,CHE, Yan-fei,HONG, Rui,CHEN, Bin |
| 초록 |
[목적] 중국 얼룩날개 모기(Anopheles sinensis) CYP6Y 서브패밀리 유전자를 감정하고 그것들의 구조와 특성을 분석하여 그 가능한 기능을 추측한다. [기법] 감비아 모기(Anopheles gambiae) CYP6Y1을 의문 서열(query sequence)로 하고, 쌍방향 Blast 방법을 통하여 모기 전사체 중 CYP6Y 서브패밀리 유전자를 검색하였으며, 생물정보학 방법을 통하여 유전자 구조, 특성 및 가능한 기능을 분석하였다. [결과] 모기 전사체 시퀀싱 데이터로부터 2개 CYP6Y 서브패밀리 유전자를 감정하였으며 각각 AsCYP6Y1(GenBank 등록번호: KF709397)와 AsCYP6Y2(GenBank 등록번호: KF709398)로 명명하였다. 서열 분석 결과, AsCYP6Y1과 AsCYP6Y2 전체길이는 각각 1,713bp와 1,815bp이었으며 각각 502와 526개 아미노산을 코딩하였다. 유전자 구조 분석 결과, 해당 서브패밀리 유전자는 1개의 위상 '1' 인트론(intron)만 함유하였으며, 기타 P450 유전자와 보수적인 공선형 분포를 형성하였다. 단백질 구조 분석 결과, 이 2개 유전자가 코딩한 단백질은 P450의 특유한 5개 특징적 서열과 6개 기질 결합 위치점을 함유하였으며, 신호 펩타이드가 존재하지 않았고 그 아세포는 세포질에 위치하였다. 3D 구조 분석 결과, AsCYP6Y1은 18개 α 나선과 13가닥의 역평행 β-strands가 있었으며 AsCYP6Y2는 19개 α 나선과 11가닥의 역평행 β-strands가 있었다. 같은 방법을 통하여, An. darlingi에서도 2개 CYP6Y 서브패밀리 유전자를 감정하였다. 계통진화 분석 결과, AsCYP6Y1과 AsCYP6Y2는 각각 기타 3가지 모기의 CYP6Y1과 CYP6Y2와 한 군집을 이루었으며, Bootstrap값은 90%보다 컸다. 교체율 분석 결과, 모기 AsCYP6Y1 및 AsCYP6Y2와 기타 3가지 모기 상동유전자의 Ka/Ks는 1보다 작았다. 상대 진화 속도 분석 결과, 모기 CYP6Y와 CYP6M 서브패밀리의 상대 진화 속도는 CYP6P 서브패밀리에 비해 뚜렷하게 빨랐으며 CYP6Y와 CYP6M 서브패밀리 사이에 뚜렷한 차이가 없었다. [결론] 모기와 An. darlingi에서 2개의 CYP6Y 서브패밀리 유전자가 존재하였고 이전에 감비아 모기와 An. funestus에서도 2개의 CYP6Y 서브패밀리 유전자를 발견하였는데 이는 CYP6Y 서브패밀리 유전자는 모기속에서 광범위하게 존재할 수 있을 뿐만 아니라 또한 모기속 곤충만이 소유할 수 있다는 것을 설명한다. |
