Microsatellite sequences for identification of Agaricus blazei mutants induced by Co60 irradiation
기관명 | NDSL |
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저널명 | 菌物學報 = Mycosystema |
ISSN | 1672-6472, |
ISBN |
저자(한글) | Chen, Jian,Weng, Boqi,Chen, Bin,Lei, Jingui,Zhu, Bingyao,Wang, Yixiang,Yang, Zhimin,Jiang, Zhihe |
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저자(영문) | |
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소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 2012-01-01 |
초록 | Streptavidin이 코딩된 자석비드(magnetic beads)와 비오틴(biotin) 특이 결합의 특성에 따라 비오틴으로 표시한 이합체 뉴클레오티드(nucleotide) 반복 서열 탐침을 이용하여 흰들버섯(Agaricus blazei) 게놈에서 미소부수체 서열(Microsatellite sequences)을 분리하였다. 결합한 streptavidin coated magnetic beads의 마커탐침을 이미 알고 있는 인공저인 서열 어댑터(artificial adapters)의 흰들버섯 DNA 효소소화 조각과 양쪽으로 연결한 후 교잡하였다. 비교잡 DNA 조각을 용리(eluting)한 후 비드(beads)가 많은 조각을 이용하여 미소부수체 라이브러리를 구축하였다. 522개의 미생물 군체를 선택하여 반복서열에 상응하는 프라이머로 PCR 선별을 거쳐 48개의 양성 클론을 얻었으며 시퀀싱을 거쳐 32개 미생물 군체가 미소부수체 서열을 포함하고 있다는 결론을 얻었다. 미소부수체의 농축 효율은 양성 클론 수의 67%를, 전체 클론 수의 6%를 차지하였다. 반복되거나 무효의 미소부수체 서열을 제외하고, 85개의 흰들버섯의 Co60 복사 돌연변이 균주를 감정하는 12쌍의 미소부수체 프라이머에서 4쌍의 프라이머가 증폭해낸 돌연변이 균주는 모두 17개였다. 이는 어떤 미소부수체 사이트는 흰들버섯 복사에 의한 돌연변이 품종의 지문 선별 및 감정에 사용된다는 것을 설명한다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART66522705 |
첨부파일 |
과학기술표준분류 | |
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ICT 기술분류 | |
DDC 분류 | |
주제어 (키워드) | simple sequence repeat (SSR),streptavidin coated magnetic beads,biotinylated probes,basidiomycota,molecular marker,단일 염기서열 반복,streptavidin coated magnetic beads,비오틴마커탐침,담자균류,분자마커 |