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논문 기본정보

Bacterial diversity of different successional stage forest soils in Dinghushan

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 微生物學報 = Acta microbiologica Sinica
ISSN 0001-6209,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) Liu, Chunlin,Zuo, Weiying,Zhao, Zengyang,Qiu, Lihong
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2012-01-01
초록 목적: 딩후산(Dinghu Mountain) 초기, 중기, 후기 3개 연속 단계의 3가지 삼림(침엽수림, 혼합수림, 활엽수림)의 토양 내 세균 군락구조 및 그 다양성을 이해하고 다양한 연속 단계에서 삼림 토양 내 미생물의 기능 및 식물의 상호 작용을 연구하는데 근거를 제공하는 것이다. 기법: 대표적인 삼림에서 샘플을 채집하여 전체 DNA를 추출해낸 후, 세균의 일반 프라이머 27F와 1492R로 16S rDNA 를 PCR 증폭하여 라이브러리(libraries)를 구축한다. 구축된 3개의 라이브러리에서 각각 150개의 양성 클론을 추출하여 삽입 조각을 시퀀싱한 후 Mothur 소프트웨어로 분석하였다. 결과: 침엽수림, 혼합수림과 활엽수림 라이브러리에서 각각 122개, 118개, 120개의 유효 16S rDNA 시퀀싱을 얻었으며 이들은 각각 70, 4, 72개의 OUTs(operational taxonomic units, 97%의 유사성을 분획 표준으로 함)를 대표한다. 분석 결과, 총 8문(phyla)의 세균을 검출하였는데 그 중 아키도박테리움균문(Acidobacteria)은 침엽수림, 혼합수림과 활엽수림 토양에서 각각 53.3%, 67.8%와 60%를, 프로테오박테리아는(Proteobacteria) 각각 29.5%, 20.3%와 32.5%를 차지했으며 피르미쿠테스균, 방선균 등 기타 균류는 10%를 넘지 않았다. 3가지 삼림 토양 내 세균 군락구조의 차이는 뚜렷하였으며 3자 사이에서 각각 두 지역이 서로 공유한 OTU 수는 검출된 전체 OTU 수의 25%보다 작았다. 그 중 활엽수림 토양 내 세균은 가장 높은 Chao 지수(414.2)와 Shannon 지수(3.90), 그리고 가장 낮은 Simpson 우점도 지수를 가졌다. 결론: 딩후산의 침엽수림, 혼합수림과 활엽수림 이 세 지역의 토양 내 세균은 종 구성에서 현저한 차이를 보였으며 그 중 활엽림 토양 내 세균의 풍부도와 다양성이 상대적으로 높았다. 그러나 세 지역의 구성은 전체적으로 유사하였고 모두 아키도박테리아가 절대적으로 지배적이었고 그 다음이 프로테오박테리아였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART66519393
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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) bacterial diversity,16S rDNA,Dinghushan,different successional stage forest,세균 다양성,16S rDNA,딩후산,다양한 연속 단계의 삼림