| 초록 |
유전자 사이의 긴사슬 비코딩 RNAs(Long intergenic non-coding RNAs, lincRNAs)는 단백질 코딩 유전자 사이에 위치하는 길이 200 nt 이상인 비코딩 RNAs다. 동물의 세포주기 조절, 면역 감시, 배아 줄기세포 분화 등 여러 가지 생물학적 과정에 참여하지만, lincRNAs는 대부분 식물에서의 기능이 아직 분명하지 않다. MicroRNAs(miRNAs)는 진핵생물 가운데 전사 수준과 전사 후 수준에서 유전자 침묵을 유도하고 21 nt 정도인 내인성, 단일 사슬, 작은 비코딩 RNAs 분자이며, 서열 보완의 방식을 통하여 표적 유전자의 발현을 조절한다. 지금, miRNAs의 표적 연구는 단백질을 코딩하는 유전자에 집중되어 있고 표적이 비코딩 RNAs인 연구, 특히 식물에서의 연구는 비교적 적다. 식물에서의 lincRNAs 기능을 체계적으로 발굴하기 위하여, 본 논문에서는 miRNAs 데이터, cDNAs 데이터와 단백질 분해 효소체(degradome) 데이터를 통합하고 생물정보학 방법을 이용하여 애기장대(Arabidopsis thaliana) 337개의 성숙한 miRNAs가 2708개 lincRNAs 위에서 가능한 위치를 찾았으며, miRNAs-mRNAs-lincRNAs 조절 네트워크를 구축하였다. 또한, 경쟁적 내인성(ceRNA) 가설에 근거하여 lincRNAs의 기능을 예측하므로써 식물에서 miRNAs의 lincRNAs에 대한 조절 메커니즘 및 lincRNAs의 기능을 한층 더 설명하는데 기초를 마련하였다. |
