저자(한글) |
DUAN, De-Min,HUI, Li-Xing,LI, Li-Shi,YAN, Xi-Yun,LI, Jiong |
초록 |
MicroRNAs(miRNAs)는 생물 체내 코딩하지 않은 작은 RNA이며 암의 발생과 밀접히 연관되어 있다. miRNAs는 잠재력이 있는 바이오마커(Biomarkers)이며 세포의 발육, 분화, 증식, 고사는 miRNAs의 조절과 연관되어 있다. miRNAs 연구에서 핵심 고리는 해당 발현 프로필에 대한 분석이다. 마이크로칩으로 miRNAs 발현 프로필을 분석함에 있어 일반적으로 교잡전에 샘플을 분리, 표기, 순화하여야 한다. 이는 전반 측정 과정에서 시간과 전력, 비용이 가장 많이 드는 절차이다. 또한 해당 과정에서 효소의 사용과 절차가 늘어남으로 하여 샘플의 목표 서열의 초기 비율에 변화를 주어서 실험 결과의 안정성에 영향을 주게 된다. 이러한 문제점들을 해결하기 위해 본 논문은 새로운 '무표기 microRNA 마이크로칩 분석' 방법을 구축하였다. 해당 기술은 스택킹 교잡(stacking hybridization) 이론에 기초하여 형광을 미리 표기한 일반 태그 서열(universal tag, UT)을 도입하였으며 SHUT(stacking hybridization-based universal tag) 측정 방법이라 명명하였다. 본 논문은 SHUT 분석의 전반 실험 과정을 체계적으로 최적화 하였고 민감성과 특이성 등 관련 지표를 평가하였다. 실험 결과, 새로운 마이크로칩 기술의 측성 민감성은 2fmol/L로써 기초군 차이가 하나뿐인 miRNAs 그룹 성분을 구분해낼 수 있을 뿐만 아니라 비활성 pri-miRNA와 pre-miRNA 전구 물질의 교차 교잡 신호를 효과적으로 제거할 수 있다. 또한 100ng의 총 RNA는 측정 분석에 사용할 수 있다. 새로운 마이크로칩 기술은 miRNAs와 기타 짧은 사슬(Short chain) 핵산 분자(nucleic acid molecules)를 측정 분석함에 있어 이상적이고 빠른 측정 플랫폼을 제공해준다. |