| 초록 |
참다래 궤양병원균(kiwifruit bacterial canker) 라카아제(laccase) 유전자의 서열 특성과 기능을 밝히기 위해 12주 참다래 궤양병원균-슈도모나스시린가에 변종(Pseudomonas syringae pv. actinidae)으로부터 라카아제 유전자를 증폭 획득하였고 각각 Psalac JF, Psalac HY, Psalac GC, Psalac HWD, Psalac INS, Psalac7285, Psalac LT12, Psalac LT16, Psalac LT26, Psalac349, Psalac Kw30, Psalac K3으로 명명하였다. 서열 분석 결과, 위 유전자 서열 간의 차이는 적은 수의 핵산 부위에 존재하는 차이일 뿐이었다. 유전자 암호화 전구간 길이는 모두 1,374 bp였고, BLAST를 사용하여 457개 아미노산 서열(N-말단의 20개 아미노산 신호 펩타이드 포함)을 암호화한 것으로 예측하였으며, 프로모터는 유전자 상위(175 bp)에 위치하였다. 생물정보학 분석을 통해 본 유전자는 라카아제 고유의 4개 Cu 2+ 활성 부위를 함유하고 있는 것을 발견하였고 활성 부위는 고도로 보존적이었다. 계통학적 분석 결과, 본 유전자의 암호화 서열과 다양한 세균의 라카아제 유전자와의 상동 관계는 아주 가까운 것으로 나타났고 이 가운데 P. fluorescens Pf0-1과의 상동성은 가장 높았다. 궤양병원균은 세균 라카아제 유전자 패밀리를 함유하고 있는 서열 특성을 일반적으로 가지고 있다는 것이 연구에서 밝혀졌다. 본 유전자는 아마도 궤양병원균 발병성과 Cu 2+ 내성 조절에 관여하는 것으로 추정된다. |
