| 저자(한글) |
CHEN, Ying-ying,MIAO, Liang,LI, Ming-yun,ZHANG, Xiao-li,GUO, Xiao-fei,PAN, Na,CHEN, Jiong |
| 초록 |
민어(Miichthys miiuy)의 계통발생학적 지위를 분석하기 위해 민어과(Sciaenidae) 어류의 계통 분류에서 18S rRNA, COⅡ 분자 표기의 타당성을 연구하였다. 민어의 18S rRNA 유전자, 미토콘드리아 COⅡ 유전자를 복제 및 서열분석한 후 NJ 계통수를 작성하였다. 연구 결과, 증폭하여 얻은 민어 18S rRNA 유전자는 1,305 bp였고 A+T 함량은 46.2%였다. COⅡ 유전자 서열은 854 bp였고 A+T 함량은 53.5%였으며 항G 편향(anti-G bias)은 뚜렷하였고(15.2%) 699 bp 길이의 개방형 해독틀(ORF)을 함유하였으며 233개 아미노산을 암호화하였다. 18S rRNA 서열을 기반으로 작성한 계통수에서 나타나듯, 농어목(Perciformes) 어류는 하나의 계통군(clade)으로 긴밀하게 군집하였고 농어목 아래 각 과에 속하는 어류 간 18S rRNA 서열의 상동성은 97.8%보다 컸다. 이러한 결과는 민어과에서 민어의 계통발생학적 상황을 보여줄 수 없었다. COⅡ 서열을 기반으로 작성한 계통수에서 나타나듯, 농어목 어류는 두개 계통군으로 구분되었다. 민어를 포함한 모든 민어과 어류는 하나의 큰 계통군으로 군집하였고 기타 각 과는 다른 하나의 큰 계통군을 형성하였다. 이중 민어와 황순어(Bahaba taipingensis)의 유전적 유연관계는 가장 가까웠고 두 서열의 상동성은 97.4%였다. 민어과 어류가 군집하여 형성한 계통군에서 일부 분기의 bootstrap 값은 비교적 낮고( 연구 결과는 민어의 분자계통학 자료를 풍부하게 하였고 민어의 계통발생학적 지위, 민어과 어류의 진화관계를 연구하는데 참고자료를 제공하였다. |
