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논문 기본정보

Phylogenetic Analysis of the PDR Protein Family in Plant

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 基因組學與應用生物學 = Genomics and applied biology
ISSN 1674-568x,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

저자, 소속기관, 출판인, 간행물 번호, 발행연도, 초록, 원문UR, 첨부파일 순으로 구성된 논문저자 및 소속기관 정보표입니다
저자(한글) Xie, Xiaofang,Chen, Zhiwei,Wu, Weiren
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2012-01-01
초록 식물의 다제내성(pleiotropic drug resistance, PDR) 단백질 서브 패밀리는 ATP 결합카세트(ATP-binding cassette, ABC) 단백질 패밀리의 일종으로, 생물 체내 다양한 물질의 운반에 참여하고, 생물의 일부 중요 생리과정에 중요한 역할을 한다. 본 연구는 생물정보학적 방법을 사용하고, 식물에서 이미 분리해낸 PDR 단백질을 색출 서열로 간주해서 전체 게놈 수준에서 논벼, 레인하드티, 이끼의 단백질 서열을 스크리닝함으로써 최종 30개의 PDR 후보 단백질을 색출하였는데, 그 중에는 논벼 단백질 15개, 레인하드티 단백질 5개, 이끼 단백질 10개가 포함되었다. ESTs 발현 분석을 통해 그 중 27개 단백질에서 발현 증거를 찾았다. 상응한 단백질의 구조와 유전자 사이의 계통발생학적 관계를 분석한 결과, 식물의 PDR 단백질은 고도 보수적인 유전자 서열을 보유하고, 단백질 중의 배열순서도 기본적으로 일치했다. 아울러 이 단백질 패밀리는 하등 조류 식물에서 벌써 분화해 기본적인 특징이 형성되었고, 고등 식물에서는 생물 종의 특수 방식으로 증폭이 진행되었다. 인트론/엑손의 구조를 분석한 결과, 하등 조류 식물의 PDR 단백질의 인트론 수가 가장 많았는데, 이는 이끼, 논벼 등 고등 식물로의 진화과정에서 인트론이 결실되었음을 뜻한다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART66523693
첨부파일

추가정보

과학기술표준분류, ICT 기술분류,DDC 분류,주제어 (키워드) 순으로 구성된 추가정보표입니다
과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Plant,PDR protein family,Evolution,Bioinformatics,식물,PDR 단백질 패밀리,진화,생물정보학