| 저자(한글) |
YANG, Ying-yuan,LIU, Nan,ZUO, Qing-qiu,REN, Qing-peng-cuo,XIE, Fei,YANG, Gang,WANG, Zheng-huan |
| 초록 |
티벳 여우(Tibetan fox)는 중국 칭장고원 동부 다방조충(Echinococcus multilocularis)과 Echinococcus shiquicus의 가장 주요한 야생동물 최종 숙주이다. 포낭충(Echinococcus)은 포낭충 질병이라는 치명적 인수 공동 질병을 유발하며, 칭장고원 동부 목축 지역은 해당 질병이 유행하는 중요한 지역이다. 최종 숙주로서 티벳 여우 개체군의 포낭충 감염율을 평가하는 것은 해당 질병의 전염병학적 연구에 뚜렷한 의의가 있다. 해당 방면의 정보를 얻으려면 먼저 티벳 여우의 개체군 수량을 이해해야 한다. 본 논문에서는 비 손상 샘플링 원칙에 기초하고, 티벳 여우의 분변을 연구 재료로 하였으며, 기존에 발표된 티벳 여우 및 근연종의 48개의 미세위성(Microsatellite) 사이트에서 11개를 선택하여 티벳 여우 분변 DNA를 다형성 분석하였다. 2011년~2012년 7~8월 사이에 수집한 128개의 유효한 티벳 여유 분변 샘플(2011년의 68개, 2012년의 60개)에 대하여 특이적 PCR 증폭을 진행하였으며, 아가로스 겔 전기영동법(Agarose Gel Electrophoresis)과 형광 프라이머 표지법을 이용하여 유전형질 분석(Genotyping)을 진행하였다. 다양한 사이트의 대립유전자 빈도(Allele frequency)에 근거하여 다양한 사이트의 유전자형 수량(N), 기대 이형접합도 (expected heterozygosity, H e ), 관측 이형접합도 (Observed heterozygosity, H o ), 다양성 정보 상수(Polymorphism information content, PIC) 및 서로 다른 개체의 유전자형의 동일개체 확률(probability of identity, PI)를 계산하였다. 연구 결과, 다양한 사이트의 N는 4-7이고, H e 는 0.66-0.80이며, H o 는 0.17-0.68, PIC는 0.5496-0.7623이었다. 11개 사이트의 누적 PI값은 개체의 식별 수요를 만족한다(PI biased =1.283 1.283×10-11, PI sibs =7.5 7.572×10-5). 그러나 분변 DNA의 질량이 비교적 큰 차이가 있어서 다양한 사이트의 증폭 성공률은 큰 차이가 있다(0.176~0.926). 연구 결과에 의하면 증폭 성공률이 높은 것에서 낮은 것으로 배열한 결과, 앞 6개 미세위성 사이트(P03, CXX172, CPH6, CPH8, P01i, P08)의 증폭 성공률은 0.6 이상이고, 누적 PI값은 0.004보다(PI biased =2.775 2.775×10-7, PI sibs =3.6 3.606×10-3) 작으며, 상술한 6개 사이트로 티벳 여우 개체를 식별할 수 있다는 것을 말해준다. 본 연구의 데이터에 대하여 다음과 같은 개체 식별 원칙을 제정하였다. (1) 분변 DNA에서 앞 6개 미세위성 사이트의 샘플을 성공적으로 증폭해야만 다음 단계 분석을 진행할 수 있다. (2) 모든 사이트의 정보에서 같은 두 가지 샘플은 같은 개체로 본다. (3) 만약을 대비해, 한 쌍의 사이트의 정보가 같지 않아도 해당 두 가지 샘플을 여전히 같은 개체로 본다. 해당 기초에서 2011년의 샘플로부터 30개의 티벳 여유 개체를 식별하였으며 2012년의 샘플로부터 21개의 티벳 여우 개체를 식별하였다. |
