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논문 기본정보

Complete genome sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS4. 0325, a bacterium newly isolated from Koumiss in Xinjiang, China

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 微生物學報 = Acta microbiologica Sinica
ISSN 0001-6209,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

저자, 소속기관, 출판인, 간행물 번호, 발행연도, 초록, 원문UR, 첨부파일 순으로 구성된 논문저자 및 소속기관 정보표입니다
저자(한글) YANG, Xiao-chun,WANG, Yu-tang,ZHOU, Ying,GAO, Xiao-feng,LI, Bai-liang,HUO, Gui-cheng
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 【목적】Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS4. 0325의 생리 및 대사 메커니즘을 규명하고 그 중요한 기능성 유전자를 발견하고자, 균주 KLDS4. 0325의 전체 유전자 서열을 측정하고 유전체 지도를 제작하였으며, 바이오 소프트웨어와 데이터베이스를 이용하여 서열에 주석을 달고 관련 기능성을 분석하였다. 【기법】균주 서열에 대한 시퀀싱, 조립, 주석을 완성한 후, 서열의 정보에 근거하여 전체 유전체 지도를 제작하였고, 균주의 단백질 가수분해 시스템, 아미노산 유래의 향미 형성 경로와 B족 비타민의 합성 경로와 관련되는 유전체를 분석하였으며, 박테리오신(bacteriocin) 합성 유전체와 저온 스트레스 단백질(cold stress protein) 유전자를 예측하였다. 【결과】균주 KLDS4. 0325 유전체의 전체 길이는 2,589,250 bp, G+C 함량은 35.4%였으며, 검출한 개방형 해독틀은 2,662개, 그 중 잠재적인 생물학적 기능을 갖고 있는 것은 1,310개 였다. 균주는 세포외 단백질을 효과적으로 가수분해시킬 수 있었고, 또한 쓴맛 펩티드(bitter peptide)를 줄일 수 있었으며 일련의 안지오텐신 전환효소(angiotensin-converting enzyme)를 억제할 수 있는 잠재적인 활성 펩티드를 갖고 있었다. 아미노기 전이경로 측면에서, 균주 KLDS4. 0325는 비교적 완벽한 효소 시스템을 갖고 있었으며, 관련 아미노산이 향과 맛을 내는 물질로 전환하도록 촉매작용을 하였다. 균주 KLDS4. 0325의 유전체에서 당(sugar)의 수송, 대사 및 L-젖산(L-lactic acid)의 합성을 코딩할 수 있는 유전자가 비교적 많이 발견되었다. 엽산(folic acid)과 리보플라빈(riboflavin) 합성 경로와 관련되는 코딩 유전자는 균주 KLDS4. 0325 유전체에서 비교적 완전한 상태로 존재하였다. 또 균주 KLDS4. 0325의 유전체에서 Lactococcin과 관련되는 1개의 유전자 집단과 2개의 저온 스트레스 단백질 CspD과 cspE의 코딩 유전자를 식별하였다. 【결론】이러한 코딩 균주에 존재하는 뚜렷한 특성을 갖고 있는 유전자는 균주 KLDS4. 0325의 산업용 발효를 위하여 이론적 근거를 제공하였으며, 또한 심층적인 연구를 위하여 방향을 제공하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART72501891
첨부파일

추가정보

과학기술표준분류, ICT 기술분류,DDC 분류,주제어 (키워드) 순으로 구성된 추가정보표입니다
과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) genome sequence proteolytie system,amino acid metabolism,B-Group vitamin biosynthesis,bacteriocin biosynthesis,cold stress protein biosynthesis,in silico analysis,단백질 가수분해 시스템,아미노산 대사,B족 비타민 합성,박테리오신 유전자 집단,저온 스트레스 단백질 유전자,생물정보학적 분석