초록 |
본 실험에서는 검은시나무(Populus trichocarpa) 히스톤 탈아세틸효소(histone deacetylase) 유전자 HDA901의 코딩 서열을 복제하였으며, 생물정보학, 세포내 위치 예측과 염 스트레스 발현 분석을 진행하였다. 서열 분석 결과, HDA901의 개방해독틀은 1,245 bp이며, 414개 아미노산 잔기로 조성된 1개 단백질을 코딩하고, 등전점은 5.77이다. 검은시나무 HDA901은 기타 식물의 상동성 단백질과 보존 서열을 갖고 있으며, 진화 과정에서 애기장대 AtHDA14와의 혈연관계가 비교적 가까웠다. 프로모터 분석 결과, 검은시나무 HDA901 유전자 프로모터 서열은 ACE, ABRE, HSE와 TC-rich repeats 등 여러개 역경 관련의 시스-작용 요소를 포함하였다. 세포내 위치 예측 분석 결과, 검은시나무 HDA901 단백질은 세포핵과 세포질에 분포되지 않았으며, 미토콘드리아에 위치하였거나 미토콘드리아와 엽록체 사이에 있었다. 실시간 형광 정량 PCR 결과, 검은시나무 HDA901 유전자 발현은 염 스트레스에 의해 조절되며, 염 스트레스에서 뿌리와 줄기 중 HDA901 유전자 발현은 억제되었다. 잎 중 HDA901 유전자 발현은 유도되었다. 결과적으로, 검은시나무 HDA901 유전자는 염 스트레스 응답 반응에 참여한다는 것을 알 수 있다. |