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논문 기본정보

Virtual screening and molecular simulations of antisense peptides targeting MT1-MMP

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 生物工程學報 = Chinese journal of biotechnology
ISSN 1000-3061,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

저자, 소속기관, 출판인, 간행물 번호, 발행연도, 초록, 원문UR, 첨부파일 순으로 구성된 논문저자 및 소속기관 정보표입니다
저자(한글) ZENG, Li,TAN, Bo-wen,YANG, Ya-lan,QIU, Jin-yi,XIONG, Li-li,MAO, Can-quan
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2015-01-01
초록 멤브레인 형 1 금속단백분해효소(Membrane type-1 matrix metalloproteinase, MT1-MMP, MMP14)는 종양의 발생 발전 및 전이에서 중요한 역할을 하는 종양에 잠재된 이상적인 약물 표적이다. MT1-MMP 결합 펩티드를 얻기 위해, 연구팀은 먼저 생물정보학 방법으로 MMPs 서열을 분석하여 MT1-MMP 차이가 크고 특이성이 있는 서열을 얻었다. 이것을 센스 펩티드(sense peptide) 표적으로 사용하여 안티센스 펩티드 라이브러리(Antisense peptide library)를 설계한 후, 분자 도킹(molecular docking), 분자 동역학 시뮬레이션 및 체외 세포 실험 등 다양한 방법을 통하여 표적 MT1-MMP 안티센스 펩티드에 대한 선별과 활성 연구를 수행하였다. 다중 서열의 비교를 통하여 MT1-MMP 원형 영역의 특이성 서열 AYIREGHE(MT1-loop)을 확인하고 1,536개 안티센스 펩티드를 구축하였다. 두차례의 가상 검색을 통하여 순위 5위안의 안티센스 펩티드를 선택하여 향후 연구에 사용하였다. 이 5개 안티센스 펩티드와 MT1-MMP 사이에는 강한 상호작용이 존재하는데, 센스 펩티드 영역과 잘 결합이 되었다. 그리고 MMPs 기타 패밀리 성원(MMP1-3, MMP7-13, MMP14HPX, MMP16)과의 친화력을 한층 더 분석하였다. 그 결과 안티센스 펩티드 FVTFPYIR의MT1-MMP에 대한 특이성이 더욱 강했다. 분자 동역학 시뮬레이션을 통하여 안티센스 펩티드 FVTFPYIR가 수용체 MT1-MMP의 구상 안정성에 영향을 미치고, 따라서 그의 기능 활성에 영향을 미치는 것으로 확인되었다. 체외 세포 실험 결과, 안티센스 펩티드 FVTFPYIR는 MT1-MMP을 발현하는 인간의 골 형성 육종세포(Osteogenic sarcoma cell) MG63와 유선암 MDA-MB-231 세포의 증식을 억제할 수 있었다. 본 연구는 항종양 안티센스 펩티드의 선도적인 약물 연구에 새로운 아이디어와 경로를 제공하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART72513952
첨부파일

추가정보

과학기술표준분류, ICT 기술분류,DDC 분류,주제어 (키워드) 순으로 구성된 추가정보표입니다
과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) membrane type-1 matrix metalloproteinase(MT1-MMP,MMP14),antisense peptide,molecular docking,molecular dynamics simulation,막 유형 1기질 금속 단백질효소(MT1-MMP,MMP14),안티센스 펩티드,분자 도킹,분자 동역학 시뮬레이션