| 초록 |
[목적] 맹그로브 토양(mangrove soil) 중에서 폴리케타이드 합성효소(Polyketide synthase, PKS) 유전자의 다양성과 참신성을 탐구하는 것이다. [기법] I형과 II형 PKS 유전자 Ketosynthase(KS) 영역의 퇴화한 프라이머로 중국 하이난(Hainan) 칭란강(Qinglan Harbor) 맹그로브의 Bruguiera sexangula, Hibiscus tiliaceus, 은박(Silver leaf), Acanthus ilicifolius 4가지 맹그로브 근권 토양 샘플 중의 DNA에 대하여 PCR 증폭을 진행하였으며, 그 후 PCR-제한효소단편길이다형성(restriction fragment length polymorphism, RFLP)과 시퀀싱 분석법을 이용하여 I형과 II형 PKS 유전자의 다양성에 대하여 탐구하였다. [결과] 얻은 72개 I형 PKS 유전자의 KS 영역 DNA 서열에 대하여 PCR-RFLP 분석을 진행하였으며, 총 51개 조작 가능한 분류단원(Operational taxo-nomic unit, OTUs)을 얻었다. 그 중 37개 OTUs는 단클론(single clone) 생산이며, 현저한 우위 OTU가 없었다. 26개의 서로 다른 OTU를 대표하는 클론을 선택하여 시퀀싱 분석을 진행하였는데, 이러한 서열과 GenBank 중 이미 알려진 서열의 최대 유사도는 85%를 초과하지 않았다. KS 영역에서 아미노산 서열의 계통발육 분석결과, KS 영역은 광범위하였으며 남세균(Cyanobacteria), 프로테오박테리아(Proteobacteria), 피르미쿠테스(Firmicutes), 방선균(Actinobacteria)과 일부 미배양 가능 세균을 포함하였다. 55개 PKS II형 유전자 KS 영역의 DNA 서열에 대한 PCR-RFLP 분석 후 총 25개 OTUs를 얻었으며, 2개의 현저한 우위 OTUs가 있었고, 대표적인 클론자 개수가 차지하는 비례는 10%를 초과하였다. [결론] PCR-RFLP 분석결과, 맹그로브 근권 토양 중에는 풍부하고 다양한 I형과 II형 PKS 유전자가 존재하고 있으며, I형의 다양성이 더 높았다. 낮은 서열 유사도 결과, 획득한 PKS I형 유전자 KS 영역의 서열은 독특하였다. 계통발육 분석결과, 얻은 PKS I형 유전자 기원은 광범위하였다. |
