| 저자(한글) |
HUANG, Jin-qiang,LIU, Zhe,WANG, Jian-fu,CAI, Yuan,FENG, Zhi-yun |
| 초록 |
본 논문은 알칼리성 염류 연못(saline-alkaline ponds)에서 양식한 잉어(Cyprinus carpio L.)의 장내미생물(intestinal microflora)의 조성과 다양성을 요해하기 위해 잉어의 장도미생물 유전체 DNA를 추출한 후 세균 특이적 프라이머(bacteria-specific primers)를 선택하여 16S rRNA 유전자에 대하여 PCR 증폭을 진행하였으며, 또한 세균 16S rRNA 유전자 클론 라이브러리(clone library)를 구축하였다. 양성 클론체(positive clones)에 대하여 제한효소 단편길이 다형성분석(restriction fragment length polymorphism, RFLP)을 진행하여 주요 클론체를 선발한 후 서열분석, BLAST 비교분석을 진행하였으며, 또한 계통수(phylogenetic tree)를 구축하였다. 본 연구에서는 16S rRNA 유전자 라이브러리에서 176개의 양성 클론체를 선별한 후, RFLP 분석을 통하여 28개의 서로 다른 조작분류단위(operational taxonomic unite, OTU) (유전자 은행 등록번호: JX262557~JX262584)를 얻었는데 라이브러리 분포 범위(library covered)는 88.6%에 이르렀다. 16S rRNA 서열 계통발생분석을 진행한 결과, 알칼리성 염류 연못에서 양식한 잉어의 장내미생물은 프로테오박테리아문(Proteobacteria) [Alpha와 Gamma 하위그룹(subclasses) 포함], 피르미쿠테스문(Firmicutes), 박테로이데테스문(Bacteroidetes)과 푸조박테리아문(Fusobacteria) 등 4가지 종류의 문에 속하였으며, 또한 총클론수(total number of clones)의 89.9%, 7.9%, 1.1%와 1.1%를 차지하였다. 그 중에서 프로테오박테리아문 중의 alpha;-프로테오박테리아강(총클론수의88.1%)은 우점군(dominant group)에 속하였으며, 아에로모나스속(Aeromonas)은 우점속(dominant genera)에 속하였다. 연구결과는 알칼리성 염류 연못에서 양식한 건강한 잉어의 장내미생물 군집조성을 규명하였다. |
