| 저자(한글) |
ZHU, You-yin,SHAO, Xu,WANG, Yue,LI, Yong-qiang,GUO, Wei-dong |
| 초록 |
MADS-box 전사인자가 식물의 꽃과 열매의 발육 과정에서 중요한 조절 작용을 발휘한다. 본 논문에서는 앵두 싹의 전사체 분석을 통하여 전체 길이의 개방형 해독틀이 있는 MADS-box 전사인자를 18개 얻었으며 생물정보학적 방법을 이용하여 해당 전사인자가 인코딩한 아미노산의 기본 성질과 구조를 체계적으로 분석하였다. 연구 결과, KP347550과 KP347552를 제외하고 모두 MIKC 집단에 속하였으며 대부분이 불안정 알칼리성 친수 단백질이고 2차 구조에서 동시에 α-나선(α-Helical), β-회전각(β-angle), 확대 사슬(Extended chain), 불규칙 코일(random coil) 구조를 갖고 있었으며 그중 α-나선이 차지하는 비율이 가장 높았다. 아세포 위치결정 분석 결과, MADS-box 단백질은 주로 세포핵에 위치결정 되었으며 KP347549는 세포질에 위치결정되고 KP347545와 KP347552가 세포막에 위치결정 되는 확률이 비교적 높았다. 서열에는 주로 4개의 보존적 서열이 함유되어 있으며 그중 서열1이 해당 유전자 집단에서의 보존적 서열이고 MADS-box를 함유하고 있다. PpcMADS 전사인자를 AP3 하위집단, PI 하위집단, SHP 하위집단, AG 하위집단, AP1 하위집단, SEP 하위집단, SOC 하위집단, SVP, 하위집단 및 4개의 미지 집단으로 나눌 수 있다. KP347545, KP347546, KP347547, KP347549, KP347551, KP347552, KM243373, KM243375와 KM243377는 꽃에서만 발현되며 KP347548과 KP347550은 꽃과 열매에서 모두 발현되지 않고 기타 7가지 유전자는 두가지 조직에서 모두 발현되었다. |
