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논문 기본정보
A Network-based Strategy From The Global Perspective for Identification of Risk Pathways in Complex Diseases
논문 개요
| 기관명 | NDSL |
|---|---|
| 저널명 | 生物化學與生物物理進展 = Progress in Biochemistry and Biophysics |
| ISSN | 1000-3282, |
| ISBN |
논문저자 및 소속기관 정보
| 저자(한글) | DENG, Li-li,XU, Yan-jun,ZHANG, Chun-long,YAO, Qian-lan,FENG, Li,LI, Chun-quan |
|---|---|
| 저자(영문) | |
| 소속기관 | |
| 소속기관(영문) | |
| 출판인 | |
| 간행물 번호 | |
| 발행연도 | 2015-01-01 |
| 초록 | 복잡한 질병의 발생 및 진행은 생체내 생물학 경로의 기능 장애와 밀접한 연관이 있다. 고속 대량 데이터를 토대로하고 컴퓨터 보조 방법을 사용하여 질병과 경로 간의 관계를 연구하는 것은 중요한 의미가 있다. 본 논문은 네트워크에 기반하는 전역성 경로 식별 방법을 새롭게 제안하였다. 본 방법은 단백질의 상호작용 정보와 경로의 유전자집단(gene sets) 구성 정보를 활용하여 복잡한 단백질-경로 네트워크(protein-pathway network)를 구축하였다. 그 다음 발현 프로파일 데이터에 기반하고 랜덤워크(random walk) 알고리즘을 통해 전역 차원에서 질병 위험 경로(risk pathway)를 최적화하였다. 최종적으로 퍼뮤테이션 방법(permutation method)을 통해 통계학적으로 유의 수준에 도달한 위험 경로를 식별하였다. 결장직장암 위험 결로 식별에 본 네트워크를 적용하여 결장직장암 발생 및 진행 과정과 뚜렷한 상관성이 있는 15개 경로를 식별하였다. 기타 경로 식별 방법(초기하 검증법, SPIA)과 비교한 결과, 본 방법은 질병 관련 위험 경로를 더 효과적으로 식별하였다. |
| 원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART72308579 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| DDC 분류 | |
| 주제어 (키워드) | risk pathways,protein-pathway network,protein-protein interactions,random walk,위험 경로,단백질-경로 네트워크,단백질 상호작용,랜덤 워크 |