| 저자(한글) |
JIANG, Nan,ZHANG, Wei-li,LI, Jie-yu,LIU, Qi-long,LIU, Min |
| 초록 |
유차(Camellia oleifera)의 전사체 데이터에 기초한 RT-PCR과 RACE 기술을 사용하여, Unigene 서열에 근거한 유차의 디아실글리세롤인산화효소(CoDGK)RACE 프라이머를 설계하고, DGK 유전자의 전체 길이에 해당하는 cDNA 서열을 분리하여 복제하였다. 그리고 CoDGK3(GeneBank 등록 번호: KM068056)이라고 명명하였다. 유전자의 전체 길이가 1,568 bp이고 개방해독틀의 길이가 1,455 bp이며, 485개 아미노산을 코딩하였다; 아미노산에 대한 상동 비교와 서열 분석 결과, 유차와 기타 생물종의 DGK 아미노산 서열 간 유사성이 비교적 높았다. 그중에서 자트로파와 포플러 나무의 유사성이 가장 높았다(78%); 생물학 소프트웨어를 이용하여 단백질에 대한 생물 정보학 분석을 수행하여 그의 구조 특징과 물리 화학적 성질을 얻었다; 전사체 데이터에서 DGK 관련의 Unigene 서열 RTKM값과 CoDGK3 유전자에 대한 실시간 정량 PCR 분석 결과, 유차 종자의 각 발육 단계에서 CoDGK3의 발현량에는 큰 차이가 없었으며, 전사체 데이터를 이용한 분석 결과와 실시간 정량 분석 결과가 일치하였다. 이는 전사체 서열 측정의 유효성을 증명한다. |
