저자(한글) |
TENG, Fei-xiang,YU, Li-li,BIAN, Yong-hua,SUN, Jin-xia,ZHANG, Cheng-bo,WANG, Nan,YANG, Li,CUI, Yu-bao |
초록 |
본 논문에서는 ProtParam, PROSITE, Jpred, Modeller 9.12 및 ABCpred 등 생물정보학 도구를 이용하여, 집먼지 진드기(dust mite) 알레르겐(allergen) Der f 6, Der p 6, Blo t 6의 물리 화학적 성질, 1차 구조, 2차 구조, 3차 구조 및 항원 결정부위(epitope)를 예측하고 비교하였다. Der f 6, Der p 6, Blo t 6 아미노산 서열의 일치성은 78.35%이며, 모두 3개 트립신 활성 사이트 아미노산과 2개 기능 구조 영역의 특이성 서열을 함유하였다. 2차 구조와 3차 구조는 모두 α-나선, β-중첩과 불규칙 코일(random coil)로 구성되었다. 활성 사이트 아미노산은 3차 구조에서 완전히 중합되었으며, 서로 근접하여 프로테아제 활성 센터를 구성하였다. 주요 잠재적 항원 결정부위 영역은 4~5개이며, 37~38 aa 번째와 2175~179 aa 번째 영역에서 중합되었지만, 결정부위 중합 영역의 아미노산 종류는 완전히 달랐다. 본 연구는 생물정보학 방법을 이용하여 Der f 6, Der p 6, Blo t 6 구조와 항원 결정부위 분야의 정보를 예측하고 비교하였으며, 알레르겐의 기능을 한층 더연구하고 백신을 개발하는데 기초를 마련하였다. |